Tanto el segundo como el cuarto ejemplo me parecen naturales. Incluir el signo de interrogación al revés puede ser ligeramente preferible, pero a veces agregar un carácter poco usado puede aumentar los gastos y los problemas de imprimir un libro.

Dicho esto, los estilos de puntuación varían entre países, entre diferentes editoriales e incluso entre diferentes editores. Si está enviando su manuscrito a una editorial, mire otros libros publicados por la misma compañía y copie la puntuación que usan.

Sin embargo, para ser honesto, no veo ninguna razón para tener el español para "¿Qué está pasando?" aparecer en el idioma original cuando su libro está en inglés. La convención habitual es traducir todo al idioma en el que se cuenta la historia, salvo algunas exclamaciones ¹o saludos que dan una idea del escenario de la historia, o para diálogos donde el hecho de que las palabras habladas estén en otro idioma es importante para la trama. "¿Que esta pasando?" es una pregunta directa que cualquier persona en cualquier parte del mundo podría hacer. La única razón por la que lo pondría en español sería si quisiera darle al lector sigilosamente una pequeña lección de idioma porque más adelante tuve un giro en la trama por el cual el lector necesita saber esas palabras en español en particular. Incluso entonces, probablemente solo daría las palabras en español y dejaría que el lector descubra el significado del contexto.

¹ Lo que daría lugar a una pregunta similar a la tuya pero con signos de exclamación, o exactamente a la misma pregunta que la tuya dado que muchas exclamaciones son en forma de preguntas, así que estoy lejos de decir que tu pregunta no es válida, solo que proporcionar palabras "ordinarias" en ambos idiomas parece laborioso.