¿Es posible producir una masa tangible de ADN/ARN mediante una reacción de PCR?

Una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es un método de amplificación que permite producir muchas copias de una determinada cadena de ADN/ARN para muchas aplicaciones (como se describe en el enlace anterior).

Nunca he visto el proceso real y la solución de PCR resultante, pero según Wikipedia, el volumen de la solución es de una magnitud de micro a mililitros.

Me preguntaba: si se permitiera que este proceso continuara una y otra vez, mientras se suministran todos los nucleótidos necesarios y otros materiales, en una magnitud de, digamos, litros, ¿podríamos terminar con una masa tangible de ADN/ARN?
En otras palabras, ¿seremos capaces de extraer de la solución una masa sólida de ADN/ARN que sea visible a simple vista? En caso afirmativo, ¿podemos predecir las características físicas de dicha masa?

Respuestas (1)

La PCR amplifica solo el ADN, no el ARN.

Una reacción de PCR suele estar dentro del volumen de microlitros y puede bajar al volumen de nanolitros para qPCR. El volumen máximo de un tubo de PCR es de 200 microlitros. El volumen máximo que puede manejar un termociclador de 96 pocillos por pocillo suele ser de 100 microlitros. Entonces, la cantidad máxima de volumen de reactivo que un termociclador puede manejar a la vez es de 9,6 ml.

Nunca he visto a nadie escalar un PCR a un volumen de mililitros, ya que eso sería bastante caro y excesivo.

Sin embargo, si por alguna razón, alguien hizo lo que dices, sí es posible obtener cantidades visibles de ADN. (Primero se requeriría la eliminación de impurezas... es decir, dNTP sin reaccionar, cebadores) Y dado que podemos obtener cantidades visibles de ADN extrayendo ADN de bacterias o esperma de salmón... Estoy seguro de que un químico en algún lugar podría predecir las propiedades físicas de esa masa de ADN.

La PCR en una escala de mililitros puede ser útil, por ejemplo, para usar como plantilla para la transcripción de ARN in vitro a gran escala. Sin embargo, no es el uso más común para PCR.
Presumiblemente, si tuviéramos que pasar por N ciclos de PCR y comenzar con unas pocas docenas de litros de solución, no veo ninguna razón por la que haya un límite en la cantidad de ADN que puede producir la PCR. La limitación está solo en el tamaño de las máquinas disponibles en el mercado, no en la química subyacente.
Aparte de los límites de la máquina, también hay otros límites presentes. El pirofosfato (PP) que se produce se polimeriza el dNTP es un inhibidor de la enzima polimerasa. El calentamiento repetido provocará la desaminación de la citosina para formar uracilo.