Termodinámica de la formación de enlaces peptídicos

¿Cuál de los siguientes muestra los cambios correctos en las propiedades termodinámicas de una reacción química en la que los aminoácidos se unen para formar una proteína?

A) +ΔH, +ΔS, +ΔG
B) +ΔH, -ΔS, -ΔG
C) +ΔH, -ΔS, +ΔG
D) -ΔH, -ΔS, +ΔG
E) -ΔH, +ΔS, +ΔG
Respuesta: C

Sé que la deshidratación es endergónica (+ΔG).

Tengo dos preguntas:

  1. ¿Por qué disminuye la entropía? Al comienzo de la reacción, tenemos dos aminoácidos. Por deshidratación, tenemos al final dos moléculas: los dos aminoácidos juntos y la molécula de H 2 O. El mismo número de partículas antes y después.

  2. ¿Por qué el cambio de entalpía es positivo? Hiciste un enlace entre los dos aminoácidos. Eso es exotérmico.

No creo que C sea la respuesta. La respuesta debería ser D. Hay una disminución neta de la entalpía porque se necesita energía para romper un enlace peptídico.

Respuestas (1)

La energía utilizada para catalizar la reacción de la peptidil transferasa proviene de la ruptura del enlace entre el aminoácido en cuestión y el aminoacil-tRNA al que está unido. Las dos reacciones están acopladas por el ribosoma. Luego, el ribosoma puede reducir la entropía colocando las moléculas (incluida el agua) en el sitio activo como se describe aquí .

Entonces tenemos nuestra reacción ΔG = ΔH - TΔS

Tu ΔG es positivo porque tu reacción es endergónica , y el ΔH es positivo porque el enlace peptídico es el sistema y estás absorbiendo energía para formarlo. La entropía está disminuyendo como tal (eliminación de energía = eliminación de calor del exterior del sistema) y la reacción real para la formación de un enlace peptídico es desfavorable. Como mencioné anteriormente, esta reacción desfavorable se acopla a una reacción favorable en la hidrólisis de un aminoacil-tRNA para que sea posible. Lo que olvidé mencionar anteriormente es que el ribosoma también lo hace más favorable al disminuir la entropía de activación de la reacción, y eso es lo que describen en la revista vinculada.

Responda ambas preguntas para que la respuesta sea completa.
@yolo hizo lo que pensé que eran ediciones sensatas.