Pros y contras de la estructura de aminoácidos frente a las secuencias de ADN para la comparación evolutiva [cerrado]

Esta es una pregunta de análisis para un laboratorio sobre las diferencias de aminoácidos en la globina beta entre diferentes primates, y el uso de tales diferencias para construir un cladograma e inferir relaciones evolutivas a partir de él. ¡Cualquier aporte es muy apreciado!

Pregunta: ¿Cuáles cree que son las fortalezas y debilidades de usar la estructura de aminoácidos de las proteínas para el análisis evolutivo? En tu opinión, ¿sería más útil usar secuencias de ADN para este tipo de comparación evolutiva entre especies vivas y existentes? ¿Por qué o por qué no?

Dado que se trata de tareas/trabajos de clase, por lo general se espera que primero muestres tu propio esfuerzo. Pero para darte una pista, la verdadera clave está en la redundancia de la secuencia de aminoácidos.

Respuestas (1)

La estructura de aminoácidos (proteína) tiene sus ventajas sobre el ADN crudo.

La estructura de la proteína ya tiene intrones (regiones no codificantes) recortados que no son obvios en una cadena de ADN simple.

Una proteína puede tener diferentes formas (como no unida/unida) o incluso plegada/mal plegada (como en el caso de los priones). El ADN no tiene una forma de codificar estos cambios, ya que dependen de los sustratos, los factores ambientales y la energía disponible.

Visualizar la estructura 3D de una proteína puede dar una idea de su funcionalidad que no se puede leer en una cadena de ADN.

Pero en el contexto de esta pregunta, queremos usar el ADN o la secuencia de aminoácidos para construir algo así como un árbol filogenético. No soy un experto en filogenética, pero asumo que la información importante estaría en esos intrones, porque generalmente tienen más libertad para mutar que los exones. Entonces, dos especies podrían tener una proteína con la misma secuencia de aminoácidos, pero diferentes secuencias de ADN en sus intrones. Podría usar esas diferencias para ayudar a identificar cómo se relacionan.