¿Se empalman algunos ARN no codificantes?

Debería consultar Howald C , et al ^[1] . Este es uno de los muchos artículos recientes vinculados a los datos de ENCODE . Usaron RT-PCR para amplificar las uniones exón-exón y luego secuenciaron los resultados. La tabla complementaria 2 muestra 3076 uniones exón-exón validadas en supuestos transcritos procesados ​​que, en el cuerpo principal del artículo, pueden subclasificarse como:

Sin codificación, 3prime_overlapping_ncrna, Ambiguous_orf, Antisense, LincRNA, ncRNA_host, Retained_intron, Sense_intronic, Sense_overlapping, Transcripción procesada.

1. Howald C, Tanzer A, Chrast J, Kokocinski F, Derrien T, Walters N, Gonzalez JM, Frankish A, Aken BL, Hourlier T, Vogel JH, White S, Searle S, Harrow J, Hubbard TJ, Guigó R, Reymond A . 2012. Combinación de RT-PCR-seq y RNA-seq para catalogar todos los elementos génicos codificados en el genoma humano. Genome Research, 22: 1698–1710, doi:10.1101/gr.134478.111 .

¿Llaman no codificante al ARN ribosomal? El ARNr se empalma tanto en procariotas como en eucariotas.

Sí, echa un vistazo a HOTAIR (en humano), así como a cyrano y megamind en pez cebra: todos están empalmados.