¿Cuál es la diferencia entre las CRE y las DHS?

Me gustaría saber cuál es la diferencia entre los elementos reguladores en cis y los sitios hipersensibles a la ADNasa I, para producir una segregación significativa de los elementos no codificantes que afectan la expresión génica.

Respuestas (1)

Los elementos reguladores cis son simplemente regiones de ADN aguas arriba o aguas abajo de un gen que pueden afectar su expresión (básicamente tienen que estar en el mismo cromosoma).

Los sitios hipersensibles a la ADNasa-I (DHS) son regiones de cromatina que se digieren durante el tratamiento con ADNasa porque están expuestas, es decir, no están protegidas por una proteína (complejo). El complejo proteico puede ser un nucleosoma o un factor de transcripción. Cabe señalar que una región de ADN puede ser insensible a la ADNasa también debido a su conformación.

Por lo general, los elementos reguladores en cis ejercen sus efectos sirviendo como un sitio de unión para factores de transcripción (o remodeladores de la cromatina). Si las proteínas se unen a estos sitios, estas regiones estarían protegidas de la digestión con ADNasa, lo que las convertiría en no -DHS. Sin embargo, se sabe que los elementos de ADN también pueden actuar en trans (véanse los artículos sobre la captura de conformación del cromosoma 3C y sus variantes). Además, si un sitio está protegido contra la ADNasa o no, no dice nada sobre su función.