¿Qué se entiende por "Expresión" de ARN no codificante?

Con muchos ARN no codificantes, el ARN es el punto final funcional. Por lo tanto, la "expresión" de ncRNA simplemente se refiere a la producción de ese componente funcional. Al igual que con las proteínas, esto implica observar la producción diferencial de tejidos de ese ARN no codificante (es decir, en qué tejidos se produce el ARN).

La expresión génica se define en el Oxford Dictionary of Biology como:

La manifestación de los efectos de un gen por la producción de la proteína, polipéptido o tipo de ARN particular cuya síntesis controla.

En otras palabras, la expresión génica significa lo mismo si el producto funcional es una proteína o un ARN no codificante. Por supuesto, no existe un componente de traducción para la expresión de ncRNA.

Consultaron las publicaciones relacionadas con el lncRNA que estudiaban si era funcional a través de la sobreexpresión o la eliminación. Las células hacen algo medible en su estado normal, que se puede observar a través de microscopía, qPCR, microarray, etc. Utiliza los datos como un control con el que comparar los resultados experimentales.

Para un estudio de sobreexpresión, por ejemplo, puede transfectar sus células con un vector que transcribirá una gran cantidad de su ncRNA. Si la transfección necesita ser estable o transitoria dependerá de una serie de otros factores. Entonces, los métodos que usó para recopilar datos como control, aplíquelos al grupo transfectado. Si hay cambios estadísticamente significativos en algo cuando tiene más ncRNA, puede decir en parte que su ncRNA es funcional. Está haciendo algo observable.

Lo contrario es cierto para la caída. Tal vez pueda usar CRISPR para hacer el trabajo, pero la transducción lentiviral con, por ejemplo, un promotor inducible por doxiciclina, está entre otras posibilidades. El objetivo ahora es hacer que el gen, o la expresión del gen, desaparezca. Haces el mismo experimento y ves si la ausencia del ncRNA le hace algo a la célula.

Ahora, en la base de datos que está viendo, la expresión se usa para mostrarle en qué tejidos se ha detectado BX118339. Básicamente dice que BX118339 se expresa en los testículos y el cerebro fetal.