En la terminación dependiente de rho en procariotas, ¿cómo “sabe” la ARN polimerasa que ha llegado al final de un gen y que tiene que detenerse para que el factor rho pueda unirse al sitio rut del ARNm? ¿Existe una secuencia de terminación en la plantilla de ADN que “señale” el final de un gen?
Y en consecuencia, ¿cómo “sabe” el factor rho cuándo unirse al ARNm?... ¿cómo reconoce el factor rho que la ARN polimerasa se ha detenido para que pueda iniciar su actividad ATPasa para disociar el complejo de transcripción del ADN y liberar el ¿ARNm?
La terminación de la síntesis de la molécula de ARN en bacterias también está señalada por una secuencia en la hebra molde de la molécula de ADN.
Esta secuencia de nucleótidos en la hebra plantilla es el sitio de pausa de la ARN polimerasa . Cuando el RNAP continúa su transcripción, llega a este sitio y detiene su actividad de transcripción aquí. La duración de esta pausa también puede verse afectada por varios factores como la alta
iones en algunos casos.
Mientras tanto, el factor rho, que después de unirse al sitio rodante, continúa su translocación a lo largo del ARNm (suponiendo que el ARNm se sintetice aquí) en dirección 5'-3' usando su actividad ATPasa. El factor rho utiliza esta oportunidad cuando RNAP ha detenido su actividad de transcripción en el sitio de pausa de RNAP para alcanzar este complejo de elongación de transcripción ternario. Cuando ha llegado a este complejo inicia su actividad helicasa dependiente de ATP que separa la hélice híbrida ARN-ADN, provocando la liberación del ARNm.
En los procariotas, la transcripción y la traducción ocurren casi simultáneamente. Aguas abajo del codón de parada de la traducción, existe un sitio rico en C en el ARNm llamado sitio de utilización de rho (rut) y otro sitio llamado punto de parada de la transcripción (tsp).
¿Cómo sabe la ARN polimerasa que ha llegado al final? La ARN polimerasa se detiene en el sitio tsp durante la transcripción. El sitio de rutina funciona como un sitio de carga de ARNm y también funciona para activar el factor rho. El factor rho activado viaja por el ARNm mientras aún está unido al sitio del celo y se pone al día con la ARN polimerasa en pausa. El contacto con la ARN polimerasa hace que la ARN polimerasa se disocie del complejo transcripcional Puede leer sobre la disociación aquí, aunque el artículo está detrás de un muro de pago .
Creo que respondí el "¿cuándo lo sabe rho?" también. Lea el artículo de wikipedia sobre esto también
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