¿Los promotores eucariotas están ubicados en la región 5' UTR?

Me preguntaba si las secuencias promotoras están ubicadas en la región 5'UTR en organismos eucariotas.

Según tengo entendido, UTR es parte del ARNm (Región no traducida), mientras que los promotores son parte del ADN, secuencias donde se une la ARN polimerasa dependiente del ADN. Entonces, por definición, los promotores no pueden estar en UTR. Más que eso, dado que RNA Pol se une al promotor, solo se puede transcribir una parte de la secuencia del promotor, si es que se puede transcribir alguna.

Respuestas (2)

La mayoría de los elementos promotores no forman parte de la secuencia de ARNm. Están aguas arriba (hacia 5') del sitio de inicio de la transcripción. Sin embargo, una determinada clase de promotores denominados elementos promotores aguas abajo (DPE) pueden superponerse con la región génica. Se ha informado que estos elementos se encuentran en 29-33 pb aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción y se emplean ampliamente en Drosophila [1] . También se ha realizado el mapeo de DPE para genes humanos de ratón [2] . Sin embargo, aún no se ha realizado un análisis detallado respaldado por buenos datos de secuenciación.

Entonces, aunque los DPE están presentes en la transcripción, no estoy seguro de si se retienen en el exón. Esto se puede confirmar mediante el mapeo de los sitios de empalme, pero este análisis no se presenta en estos documentos.

Puede ver en la siguiente figura [3] que la mayoría de los primeros exones en humanos son lo suficientemente grandes como para albergar el DPE.

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No creo que las secuencias del promotor estén en la región 5'UTR. El extremo 5' de 5'UTR es el sitio de inicio de la transcripción y el factor de transcripción general se une inmediatamente aguas arriba del extremo 5' del genoma (alrededor de 30 a 40 pb aguas arriba).

https://en.wikipedia.org/wiki/Promoter_(genética)