¿Qué es un dominio catalítico de una enzima?

¿Es este otro nombre para el sitio activo de una enzima? ¿Cómo es la estructura del dominio catalítico de una enzima?

Respuestas rápidas: sí, y varía enormemente. Las enzimas catalizan una gran variedad de reacciones, desde cortar el ADN hasta agregar aminoácidos a una cadena polipeptídica en crecimiento, hasta descomponer azúcares complejos y muchas más. Los dominios catalíticos varían de una familia de enzimas a otra, e incluso entre enzimas de una sola familia. Realmente no se puede hacer una generalización sobre la estructura o la función, ya que es muy diferente de una a otra.
AFAIK MattDMo es correcto. El sitio catalítico es el sitio activo donde tiene lugar la reacción que desencadena el cambio de conformación. También tiene razón acerca de que hay diseños de sitios catalíticos potenciales casi infinitos.
Diría que los dominios catalíticos son un poco diferentes de los sitios activos. El sitio activo es el lugar donde se unen los sustratos y se produce la reacción, el dominio catalítico es la porción de la enzima que contiene el sitio activo. Muchas proteínas tienen múltiples dominios.
Estoy de acuerdo con @ usuario137. El dominio catalítico es un subdominio del sitio activo (que también contiene dominios de unión).

Respuestas (1)

Ambas partes se superponen. Las proteínas son una cadena de aminoácidos enlazados. Esta cadena se puede agrupar en unidades funcionales que se denominan dominios proteicos . Por lo general, todas las partes de un dominio están ubicadas de cerca en la proteína y forman dominios funcionales en la estructura 3D de la proteína. Las proteínas suelen contener más de un dominio (estos son múltiples pero, por ejemplo, pueden ser dominios de dimerización, activación o unión).

El dominio catalítico es la parte de la cadena proteica que contiene la región donde tiene lugar la reacción química catalizada. La estructura 3D del dominio catalítico forma el sitio activo, por lo que la enzima requiere un plegamiento adecuado para estar activa. Si desnaturaliza la enzima, el dominio catalítico aún estará presente (ya que esto es una función de la secuencia de la proteína), pero el sitio activo desaparecerá.

Como realmente hay muchas enzimas para todo tipo de reacciones, es difícil definir una forma general para el sitio activo. Un motivo que está presente en muchas enzimas es la forma de un bolsillo o surco catalítico al que solo tiene acceso el sustrato correcto de la enzima. Además, la unión del sustrato a la enzima a menudo induce un cambio conformacional en la proteína que cierra este bolsillo. Cuando finaliza la reacción y la enzima ya no une el sustrato, la conformación cambia nuevamente y libera los productos de la reacción. Vea la imagen para un dibujo esquemático de este principio (imagen de aquí ):

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