Primeras diferencias entre árboles maduros y semillas

Para un solo locus codominante en dos poblaciones de roble azul, me dan datos de frecuencia de genotipos (los genotipos son AA, AB, BB) para árboles adultos (de al menos 150 años) en ambas poblaciones (población 1 y población 2) y a partir de muestras de plántulas tomadas en bosques fragmentados de las mismas poblaciones (población 1 y población 2) muy recientemente. Me piden que detecte cualquier diferencia en Fst entre adultos y plántulas, y propongo una hipótesis que explique cómo podría haberse producido cualquier diferencia observada.

Los datos se pueden encontrar aquí

Para abordar esta pregunta, calculé el valor Fst entre Pop1 y Pop2 usando las frecuencias genotípicas del adulto y luego Fst entre Pop1 y Pop2 para las plántulas usando las respectivas frecuencias genotípicas dadas para las plántulas.

Los valores de Fst para el adulto fueron 0,004 y la plántula fue 0,113.

Claramente hay diferenciación genética entre la población 1 y 2 en las semillas, pero no mucha en los árboles adultos.

Estoy mayormente atascado en la explicación de por qué sucedería esto. Mi respuesta instintiva fue que hay alguna selección contra ciertos genotipos adultos en la población 2 en el sentido de que no pueden producir semillas. ¿O tal vez los adultos de la población 2 no se aparean al azar y, por lo tanto, producen semillas que no coinciden con los genotipos de la población adulta?

Respuestas (1)

Asumiré que el reclamo Clearly there is genetic differentiation between population 1 and 2 in seeds, but not much in adult trees.es correcto y que ha realizado sus estadísticas correctamente.

Un análisis completo de la situación depende de cómo calculó Fst. ¿Usó Weir-Cockerham Fst o la formulación estándar de Nei? ¿Cómo promediaste (con o sin ponderaciones) la población y los loci? Pero sin entrar en estos detalles, aquí hay un escenario extremo que explica por qué podrías observar tales patrones.

Imagínese, la tasa de migración de cualquier población ya cualquier población es 0,5. En tal caso, en ausencia de selección, no esperaría ninguna divergencia entre las poblaciones. Sin embargo, si los genotipos AAy ABambos tienen una probabilidad de supervivencia de semillas de 0 en pop2 (pero no en pop1), entonces pop2 se fijará en A2A2la etapa adulta aunque al mirar las semillas no se vea ninguna evidencia de divergencia.

No entiendo muy bien tu respuesta. En el contexto de la pregunta y las frecuencias genotípicas dadas, simplemente no entiendo cómo las frecuencias genotípicas de pop1 y pop2 podrían ser muy altas en la etapa adulta, pero tener una diferenciación moderada en la frecuencia genotípica en la etapa de plántula. Pido disculpas si no estoy siendo claro..
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