¿Cómo determinar si los cambios en la frecuencia de un alelo se deben a la deriva genética o a la selección?

Dado que tanto la selección natural/artificial como la deriva genética son mecanismos evolutivos que influyen en cómo cambian las frecuencias alélicas en una población:

¿Hay formas de determinar si un cambio de frecuencia para un gen/alelo específico se debe a la deriva genética o a la selección? En otras palabras: cuando vemos que un alelo se apodera de una población, ¿hay alguna forma de saber si fue seleccionado o simplemente "tuvo suerte"?

ACTUALIZACIÓN : dado que aparentemente este tema es bastante complejo en biología experimental, quiero aclarar por qué pregunto esto y qué espero aprender.

Estoy buscando una 'manera teórica' de determinar si los cambios en las frecuencias alélicas en las generaciones posteriores son producto de la selección o mera deriva.

Estoy aplicando un algoritmo genético a la optimización de sitios web, donde cada gen determina un aspecto de la experiencia del usuario de ese sitio web. La pregunta es si los alelos que veo emerger en las soluciones más adecuadas (= la mejor experiencia de usuario, calificada por los visitantes) llegaron allí por casualidad o si realmente contribuyen a la idoneidad de la solución candidata (= marcan la diferencia en la configuración de la experiencia del usuario).

Respuestas (1)

¿Hay alguna manera de desenredar la selección de la deriva?

Sí, en realidad hay muchas formas... tantas formas diferentes que es imposible responder correctamente a esta pregunta. Con suerte, la respuesta a continuación le dará una idea de por qué existe tal diversidad de métodos y le brindará fuentes para ampliar su conocimiento sobre la pregunta.

Depende de los datos que tengas

La respuesta depende mucho de los datos que tengas en mente. ¿Estás mirando un

  • población panmíctica
  • una población estructurada
  • ¿Estás comparando una gran cantidad de linajes a lo largo de una filogenia?
  • ¿Tiene información sobre un indicador de fitness en esta población?
  • puedes realizar un experimento de evolución (depende mucho del tiempo de generación)
  • ¿Tienes datos genéticos que están separados temporalmente?
  • ...

Además, ¿en qué tipo de selección estás pensando?

  • selección de equilibrio
  • ¿Está tratando de encontrar epistasis para la selección?
  • ¿Está buscando alguna forma de selección de equilibrio?
  • Selección local
  • ...

También depende de si tiene datos sobre variables potencialmente correlacionadas, como

  • datos fenotípicos
  • datos ecologicos

Hay decenas (o incluso cientos de métodos, especialmente cuando se tienen datos sobre linajes relacionados) debajo de cada viñeta anterior, por lo que su pregunta es definitivamente bastante amplia.

Fuente de información

Las pruebas estadísticas que prueban que no hay selección a menudo se denominan "prueba de neutralidad selectiva". Es posible que desee leer Nielsen 2001 y Nielsen 2005 para obtener una descripción general de las pruebas de neutralidad selectiva en poblaciones panmícticas.

Es posible que desee echar un vistazo a esta respuesta , esta respuesta y especialmente esta respuesta .

¿Qué se necesita para entender los métodos para desenredar la selección de la deriva?

Comprender las pruebas de neutralidad selectiva puede ser un poco exigente, ya que requiere tener un buen conocimiento en estadística clásica, estadística bayesiana, MCMC, computación bayesiana aproximada e incluso algoritmos de aprendizaje automático. También requiere un buen conocimiento en genética de poblaciones (típicamente incluida la teoría coalescente) y filogenética estadística.

Un ejemplo específico

Desafortunadamente, no puedo pensar en ningún ejemplo específico de una prueba que sea realmente fácil de comprender sin un conocimiento previo. Una prueba clásica, no demasiado difícil e históricamente ejemplo de neutralidad en la población panmíctica es el uso de la D de Tajima (cuya derivación requiere conocimientos básicos en los procesos de ramificación). Es posible que desee aprender sobre esto para tener un ejemplo específico. Recomiendo el libro de Gillespie Population Genetics: A Concise Guide para aprender sobre esta prueba. Más recomendaciones de libros se pueden encontrar aquí .

Estoy buscando una 'manera teórica' de determinar si los cambios en las frecuencias alélicas en las generaciones posteriores son producto de la selección o mera deriva. Estoy aplicando esto al comportamiento que veo al aplicar un algoritmo genético donde cada gen determina un aspecto de la experiencia del usuario de un sitio web. La pregunta es si los alelos que veo emerger en las soluciones más aptas llegaron allí por casualidad o si realmente contribuyen a la aptitud de la solución candidata. Probablemente debería haber aclarado esto en mi pregunta, pero no lo hice porque no me di cuenta de la complejidad de este problema.
Le sugiero que abra una nueva publicación para esta pregunta más específica. No olvide definir claramente su modelo de algoritmo. A priori, si yo fuera usted, como primer paso, examinaría el espectro de frecuencias del sitio y realizaría una prueba D de Tajima.