Tengo dos proteínas y prepararé un vector con ambos genes para una transfección estable. Cada proteína tendrá su propio promotor y usaré el vector piggyBac para insertar un solo casete con ambos genes en los cromosomas. Mis preguntas son:
No quiero usar IRES o péptido 2A. Me gustaría poder controlar este experimento en la etapa de transcripción.
Puede utilizar un promotor bidireccional. El problema que mencionaste sobre las proteínas que no se expresan en el mismo nivel ocurre debido a la competencia por la polimerasa. Pero hay partes bien optimizadas y también vectores disponibles comercialmente que funcionan bien.
Puede clonar genes en un orden en serie. No será un problema. Simplemente deje un conector de 100 pb después de la señal poliA del gen anterior. Si su casete se vuelve demasiado grande, la inserción se vuelve un poco difícil. Es por eso que la gente usa IRES o péptidos TA, etc.
Las inserciones basadas en retrovirus funcionan bastante bien, pero no se puede controlar la variación del número de copias entre diferentes células.
Puede utilizar dos promotores diferentes. La dinámica dependerá de la fuerza del promotor y la concentración del inductor.
Estaba revisando mis preguntas y me di cuenta de que esto aún no tiene respuesta. Bueno, ahora tengo la respuesta.
Diseñé la construcción con dos promotores separados (CMV para uno y Tet-inducible para el otro) y obtuve muy buenos resultados. No he tenido ninguna dificultad para expresar las proteínas. Pude controlar muy bien la inducible por Tet y obtuve niveles constantes de la otra proteína con CMV.
Para resumir: puede colocar de manera segura dos genes bajo dos promotores separados, preparar líneas celulares estables con ellos y obtener buenos niveles de expresión.
Engin Yapicí