Leí que las interacciones Proteína-Proteína que uno puede considerar son generalmente de dos tipos, a saber, físicas y funcionales, pero no puedo diferenciar entre las dos.
Estaba pensando que si dos proteínas están vinculadas en una red de interacción Proteína-Proteína como las almacenadas en la base de datos STRING, entonces se observan experimentalmente o de alguna manera se predice que interactuarán físicamente a través de sitios de unión para realizar una función explícitamente, por ejemplo, transducción de señales. Pero como estoy leyendo diferentes fuentes haciendo la separación entre los dos tipos de interacciones, me quedé un poco desconcertado.
¿Podrías ayudarme?
Tal como lo entiendo, "físico" y "funcional" son solo dos formas diferentes de analizar una interacción entre proteínas. Las proteínas pueden interactuar físicamente y lo hacen, lo que significa que pueden unirse de maneras y sitios específicos, y esta unión puede producir cambios en esas mismas proteínas (como cambios conformacionales), que alteran sus propiedades. Este es el análisis puramente físico de la interacción de proteínas. El análisis funcional comienza cuando nos hacemos las preguntas "¿Cuál es el papel que desempeña esta interacción en la célula/organismo/sistema vivo?"; "¿Qué efectos van a crear estos cambios en la proteína en la célula/organismo/sistema vivo?". A menudo, un cambio conformacional en una proteína inducido por una interacción con otra la activa o la inactiva. En otras palabras,Función en la regulación de la actividad de la proteína. Por ejemplo, los fagocitos (células capaces de fagocitosis) tienen en sus membranas proteínas capaces de interactuar físicamente con las proteínas presentes en las membranas de los patógenos. Se unen físicamente a ellos, cambiando su conformación en el proceso. Esta es la parte física de la interacción, es lo que sucede puramente físicamente (y se puede estudiar más profundamente). Este cambio conformacional permitirá que la proteína catalice una serie de reacciones dentro de la célula fagocítica que finalmente conducirán a la fagocitosis y destrucción del patógeno.Este es el análisis funcional de la interacción, es entender qué es lo que funcionalmente logra la interacción, en este caso posibilitando la fagocitosis (y se puede estudiar más profundamente).
David
negro
David
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