Así que estoy tratando de simular la producción de ácido 3-hidroxipropiónico con E.coli a través de la ruta Propionyl-CoA. Sin embargo, no estoy muy seguro de cómo va la producción en el camino. Obtuve la siguiente imagen:
Si lo entiendo correctamente, la ruta es: Acetil-Coa--> Propionato --> Propionil-CoA --> .... --> 3-HP Al agregar estas reacciones en Cobra, ¿los coeficientes estequiométricos siempre son solo 1?
Si entiendo bien la vía es: Acetil-CoA --> Propionato --> Proprionil-CoA --> ... --> 3-HP
No exactamente. La primera reacción es: El grupo CoA se transfiere de acetato a propionato. Las siguientes reacciones son una oxidación a acriloil-CoA y una hidratación posterior a 3-HP-CoA. Por último, el grupo CoA se vuelve a transferir a acetato.
El propionato es una molécula de 3 carbonos y también lo es el 3-HP. Así que los coeficientes estequiométricos de 1 parecen lógicos.