¿Cómo funciona la transformación por choque térmico?

¿Qué sucede exactamente cuando células competentes como DH5ɑ reciben un choque térmico con ADN presente? ¿Cómo llega el ADN al interior de las células?

Específicamente, ¿por qué son necesarios todos los pasos? ¿Qué pasa si sufres un choque térmico justo después de agregar el ADN? ¿Qué pasa si no te pones hielo después del golpe de calor? ¿Qué hace el cloruro de calcio? ¿Qué sucede realmente cuando las células son "competentes"? ¿Qué gobierna la eficiencia de la transformación (además de cosas obvias como la cantidad de ADN o células)?

Para que quede claro de lo que estoy hablando, utilizo un protocolo como el siguiente:

  1. Saque las células de -80C y descongele en hielo durante 5 min.
  2. Agregue 1 ul (~500 ng) de ADN de plásmido a 50 ul de células, mezcle suavemente con la punta de la pipeta.
  3. Dejar en hielo durante 30 min.
  4. Poner en baño de agua a 42C durante 45 seg.
  5. Poner en hielo durante 10 min.
  6. Agregar 950 ul LB, poner a 37C por 1 hora.
  7. Distribuir 300 ul del cultivo en placas de LB-agar con la selección adecuada.

Por lo general, obtengo miles de colonias de esto (de hecho, a menudo es necesaria una dilución de 1:10 o 1:100 para poder obtener colonias aisladas). Incluso si me salto la consecuencia, todavía obtengo cientos.

No tengo mi protocolo celular competente, pero básicamente uso ese cloruro de rubidio que todos usan: las células DH5ɑ se lavan con algunos tampones, se suspenden en una solución con CaCl2 y RbCl, luego se congelan en nitrógeno líquido. En realidad, nunca medí, pero generalmente la concentración de células en las alícuotas congeladas es aproximadamente 10 veces mayor que la que obtendría de un cultivo líquido durante la noche (se centrifugan y se resuspenden en un pequeño volumen).

Creo que sigue siendo cierto que nadie sabe "exactamente" lo que sucede. Existe una sabiduría popular que dice que al hacer crecer las células a 37 °C y luego aplicarles un choque a 42 °C, la membrana se vuelve más fluida (verdad) y esto ayuda al ADN a cruzar esta barrera. Si alguien escribe una respuesta con evidencia de esto, por mi parte, estaré muy interesado.
@AlanBoyd He oído que muchos científicos también afirman que nadie lo sabe. Siempre me ha parecido extraño. ¿Cómo es posible que no se entienda bien una técnica tan simple y popular? ¿No se dispone de las técnicas experimentales para estudiarlo? ¿O nadie se molesta porque piensan que incluso si lo descubren, nadie lo citará ni le importará?
También aprendí/me dijeron que el mismo mecanismo es responsable de la transformación de E. coli según lo escrito por Alan Boyd. Este artículo (Transformación de gran volumen con celdas químicamente competentes de alto rendimiento y eficiencia. Focus 20:2 (1998)) parece tener muchas referencias sobre el procedimiento; sin embargo, no sé si el estudio ofrece alguna explicación mecánica de la transformación de E. coli basada en el choque térmico, ya que parece que no puedo acceder a ella/encontrarla.
No puedo estar seguro de esto, pero la competencia natural se ve afectada por el estrés ambiental. Puede ser que sea el mismo caso con la competencia inducida químicamente. Ver esta publicación.

Respuestas (1)

La transformación del choque térmico altera la fluidez de la membrana creando poros:

Un aumento repentino de la temperatura crea poros en la membrana plasmática de las bacterias y permite que el ADN plasmídico entre en la célula bacteriana.

Referencia: Revista de Experimentos Visualizados. Transformación bacteriana: el método de choque térmico. 2014. http://www.jove.com/science-education/5059/bacterial-transformation-the-heat-shock-method

El cambio de temperatura altera la fluidez del estado de la membrana semicristalina alcanzado a 0oC permitiendo así que la molécula de ADN entre en la célula a través de la zona de adhesión.

Referencia: Anh-Hue T. Tu. Transformación de Escherichia coli hecha competente por el protocolo de cloruro de calcio. 2008-2013. Sociedad Americana de Microbiología

... el paso de pulso de calor (0 grados C42 grados C) del procedimiento de transformación estándar había reducido considerablemente la fluidez de la membrana externa de las células. La disminución de la fluidez fue causada por la liberación de lípidos desde la superficie celular al medio extracelular. Un choque de frío posterior (42 grados C0 grados C) a las células elevó la fluidez aún más a su valor original y esto fue causado por la liberación de proteínas de membrana al medio extracelular.

Referencia: Panja S, Aich P, Jana B, Basu T. ¿Cómo penetra el ADN del plásmido en las membranas celulares en el proceso de transformación artificial de Escherichia coli? mol. Miembro Biol. 2008 agosto; 25 (5): 411-22. doi: 10.1080/09687680802187765 . IDPM de PubMed: 18651316.