Si una persona está infectada con un virus de ARN, ¿qué porcentaje del ARN en la sangre de la persona contiene ARN del virus?

Karius utiliza la secuenciación de ADN de todo lo que contiene una muestra para detectar todas las bacterias y virus de ADN en la muestra. Dada la forma en que los costos de la secuenciación están cayendo, este enfoque parece ser el futuro de la detección de infecciones basadas en bacterias.

Sería genial si el mismo enfoque también funcionara para los virus basados ​​en ARN. Para que funcione sería necesario, por supuesto, que haya suficiente ARN del virus en comparación con el otro ARN.

¿Cuánto ARN de virus hay en una persona infectada por un virus de ARN en comparación con el otro ARN?

No obtuviste una respuesta a tu pregunta específica, aunque @de_novo respondió una relacionada. No es posible dar una respuesta a cuánto ARN del virus hay en una persona infectada por un virus de ARN porque es demasiado general; Los virus de ARN son muy diversos e incluyen virus que están altamente localizados y no ingresan a la sangre en absoluto, así como algunos que se transmiten por la sangre y pueden alcanzar concentraciones bastante altas. Entonces, la respuesta a su pregunta sería cubrir al menos un rango de mil millones de veces, si no más, lo cual no es útil.

Respuestas (1)

Creo que tu pregunta es:

¿Puedes diagnosticar a alguien con un virus de ARN buscando ese ARN en su sangre?

El uso de pruebas de ácido nucleico o NAT en el diagnóstico existe desde hace mucho tiempo. La empresa específica con fines de lucro que mencionas no es la primera en usarlas. Casi todas las NAT funcionan amplificando primero el material genético con PCR u otros métodos, por lo que no es necesario que haya una gran proporción de ARN patógeno frente a ARN total en una muestra para usar una NAT.

Las NAT, en lugar de las pruebas basadas en cultivos o antígenos/anticuerpos, proporcionan el diagnóstico definitivo para muchos virus, incluidos los virus de ARN. Como describen los CDC , las NAT (entre otras pruebas) también se utilizan para detectar virus de ARN en la sangre donada (VHC, VIH y Nilo Occidental).

Por cierto, la compañía con fines de lucro que mencionó NO detecta todas las bacterias y virus de ADN en la muestra como dijo. Detecta un gran número de patógenos específicos en su

base de datos de referencia de microorganismos patentada

Si hay una nueva bacteria en la sangre de los pacientes, si hay suficientes bacterias en las muestras de sangre que se le dan a Karius, Karius obtiene automáticamente el ADN de esas bacterias a través de su proceso. Los fragmentos de todo el ADN de la sangre son recogidos por su proceso, incluso cuando el análisis del software no coincida con todos los fragmentos de los organismos. NAT en el sentido en que Wikipedia describe el término que en realidad tiene que saber qué organismo está buscando para elegir la cartilla adecuada. Más importante aún, su precio aumenta linealmente si está buscando más organismos.
@Christian, todavía tienes que saber lo que estás buscando en la prueba de Karius. Hace coincidir el ADN no humano en una muestra con su "base de datos de referencia de microorganismos patentada". Si no está en la base de datos, no se identifica.
@Christian además, no es necesario tener una gran proporción de ácido nucleico para que funcione este mismo tipo de prueba. Los métodos de Karius son un cambio en la escala del estándar de atención, no de tipo. Si lee los estudios de su grupo, no están utilizando una nueva técnica de amplificación o detección.
La prueba se basa en la secuenciación de ADN de próxima generación. Esa es una tecnología que recientemente se volvió mucho más barata. La página de Wikipedia sobre NAT habla sobre la unión de la sonda y el objetivo y no sobre la secuenciación de próxima generación.