Proteínas: modificación postraduccional

Soy físico y trato de entender algo de química de proteínas para un pequeño proyecto. Básicamente, los aminoácidos se combinan para formar proteínas y, después de formar la estructura primaria, pueden ocurrir algunas modificaciones químicas, como la fosforilación o la glicosilación (modificación postraduccional). En el caso de la enzima anhidrasa carbónica, se añade postraduccionalmente un ión zinc como cofactor. (La secuencia de aminoácidos se puede ver aquí (desplácese hacia abajo hasta el título de 'secuencia').

  1. ¿Se considera la unión de zinc como un tipo de modificación postraduccional?

  2. Cuando la anhidrasa carbónica se desnaturaliza, ¿se libera el ion zinc en el medio?

  3. ¿Se cambiará la secuencia de aminoácidos (estructura primaria) después de la desnaturalización? En caso afirmativo, ¿se eliminan los aminoácidos después de la desnaturalización? En caso afirmativo, ¿cuáles?

  4. Supongo que el zinc se eliminará después de la desnaturalización. ¿Es la estructura restante la estructura proteica primaria?

Respuestas (1)

1) ¿Se considera la unión de zinc como un tipo de modificación postraduccional?

Realmente no se considera una modificación postraduccional porque el átomo de zinc no está unido covalentemente a la proteína. La unión al zinc es adsorción.

2) Cuando se desnaturaliza la anhidrasa carbónica, ¿se libera el ion zinc en el medio?

Sí, pero también depende del grado de desnaturalización. Los iones metálicos se pueden eliminar usando ligandos quelantes como EDTA, sin desnaturalizar realmente la proteína.

3) ¿Se cambiará la secuencia de aminoácidos (estructura primaria) después de la desnaturalización? En caso afirmativo, ¿se eliminan los aminoácidos después de la desnaturalización? En caso afirmativo, ¿cuáles?

La desnaturalización no incluye la ruptura de enlaces covalentes. No habrá cambios en la secuencia de aminoácidos.

4) Supongo que el zinc se eliminará después de la desnaturalización. ¿Es la estructura restante la estructura proteica primaria?

Sí; solo el polipéptido.

Entonces, ¿cómo se verá la secuencia de la proteína después de la desnaturalización (la secuencia dada en el enlace de mi pregunta)? ¿Cómo sé la letra correspondiente al Zinc (¿es M?)?
@aneps Se verá igual. M es metionina