Papel de NaCl en CTAB - complejo de ADN en la extracción de ADN

Tengo una pregunta sobre el papel del NaCl en el proceso de extracción de ADN. Entonces, para concentraciones de NaCl por debajo de 0,5 M, las moléculas de CTAB y ADN pueden crear complejos. En esas concentraciones, las proteínas y otros hidrocarburos siguen siendo solubles en agua excepto el complejo ADN-CTAB. Si elevamos la concentración de NaCl, el complejo de CTAB-DNA también será soluble en agua. Corrígeme si me equivoco hasta ahora.

Entonces no entiendo algo. ¿Por qué usamos NaCl?

Supongamos que no agregamos NaCl. ¿El CTAB creará complejo con el ADN o no? Mientras leo, CTAB crea enlaces iónicos con el ADN (grupos fosfato). Entonces, en esta situación (sin NaCl), CTAB también debe poder crear complejos con el ADN.

Entonces, ¿por qué usamos NaCl? ¿Solo para mantener las proteínas y otros hidrocarburos solubles en el agua o hay algo más en lo que NaCl ayuda en esta creación compleja?

NaCl proporciona iones Na+ que bloquearán la carga negativa de los fosfatos en el ADN. Los fosfatos cargados negativamente en el ADN hacen que las moléculas se repelan entre sí. Los iones Na+ formarán un enlace iónico con los fosfatos cargados negativamente en el ADN, neutralizando las cargas negativas y permitiendo que las moléculas de ADN se unan.

Respuestas (1)

CTAB forma complejos insolubles con ácidos nucleicos y puede usarse para precipitarlos selectivamente de soluciones, consulte esta referencia:

Cuando agrega NaCl en una concentración entre 0,4 y 0,7 M, los ácidos nucleicos permanecen en la solución, mientras que los polisacáridos y otras sustancias que pueden interferir con la preparación del ADN no lo hacen. Ver este artículo: " Aislamiento rápido de ADN vegetal de alto peso molecular " .