Durante el proceso de aislamiento del plásmido, ¿cómo podemos estar seguros de que solo se ha aislado el ADN del plásmido y no hay ADN cromosómico?

Separamos la membrana y todos los demás componentes celulares, pero ¿cómo es que solo se aísla el ADN plasmídico y no el ADN cromosómico?

Respuestas (1)

Se reduce al tamaño del ADN genómico (relativamente grande) en comparación con el del ADN plasmídico (bastante pequeño).

La lisis celular para la extracción de plásmidos implica un tampón alcalino que incluye hidróxido de sodio y SDS. Tanto el plásmido como el ADN genómico se desnaturalizan en esta condición. Cuando la reacción alcalina se neutraliza con acetato de potasio, el ADN del plásmido bastante corto puede reasociarse rápidamente, mientras que el ADN genómico mucho más largo y complejo tiende a enredarse consigo mismo, lo que impide que las hebras hermanas se alineen correctamente y, a menudo, da como resultado proteínas. -Interacciones de unión al ADN.

El ADN unido a la proteína se eliminará durante la centrifugación, mientras que el ADN del plásmido soluble permanecerá en solución.

Qiagen y BiteSize Bio ofrecen una descripción más detallada del proceso: https://www.qiagen.com/us/resources/technologies/plasmid-resource-center/key%20steps%20in%20the%20plasmid%20purification%20protocols/

http://bitesizebio.com/1660/plasmid-v-genomic-dna-extractionthe-difference/

También es importante tener en cuenta que los plásmidos son cccDNA (circular covalentemente cerrado), lo que significa que las dos hebras se unirán tras la desnaturalización. Básicamente, aunque las hebras estén separadas, todavía están unidas entre sí.