En la clase de biología aprendemos que las proteínas están plegadas y que la forma que toma la proteína afecta su bioactividad. Por lo general, no profundizamos mucho más en la forma de la proteína a partir de eso, al menos no en el nivel de biología que he tomado. Ahora, mis amigos biofísicos que están trabajando en el plegamiento de proteínas me dicen que su enfoque típico para ese problema es el de la mecánica estadística. Sé que típicamente un sistema mecánico estadístico fluctúa entre sus varios microestados. Esto me lleva a preguntarme si la conformación de una proteína también oscila en torno a su conformación de equilibrio.
Gracias y saludos.
Sí, las proteínas plegadas fluctúan incluso en su estado nativo/plegado. No fluctúan como una cadena de polímero en un buen solvente, por ejemplo, sino como átomos en un sólido, donde el concepto de vecinos en 3 dimensiones está bien definido, lo que permite etiquetar los residuos si es necesario.
Por esa razón, la gente de la comunidad llama a estos estados "estados ordenados" en oposición a otro tipo de proteínas llamadas "proteínas intrínsecamente desordenadas" que no se pliegan en masa sino que necesitan interactuar con otras biomoléculas o sustratos para plegarse en estados particulares.
Tome un huevo, rómpalo y viértalo en una sartén caliente. Las proteínas se someten al calor y cambian su forma conformacional. El calor hace que estas proteínas vibren térmicamente más violentamente hasta que estas vibraciones sean suficientes para empujar las proteínas a una forma diferente. En general, la cocción de la carne hace lo mismo.
limón