Leí este artículo de wikipedia sobre el genotipado de SNP y no pude entender esta parte:
Al examinar los resultados, si una muestra genómica es homocigota, entonces los productos de PCR resultantes serán del cebador que coincide con la ubicación del SNP en el cebador de la hebra opuesta externa , así como de los dos cebadores externos opuestos. Si la muestra genómica es heterocigota, entonces los productos resultarán del cebador de cada alelo a sus respectivos homólogos del cebador externo, así como de los dos cebadores externos opuestos.
¿Alguien puede explicar esto?
XHTML válido http://nar.oxfordjournals.org/content/29/17/e88/F1.large.jpg. Figura 1. Presentación esquemática del método tetra-primer ARMS-PCR. El polimorfismo de un solo nucleótido que se usa aquí como ejemplo es una sustitución G→A, pero el método se puede usar para escribir otros tipos de sustituciones de una sola base. Se generan dos amplicones específicos de alelo utilizando dos pares de cebadores, un par (indicado por flechas rosadas y rojas, respectivamente) que produce un amplicón que representa el alelo G y el otro par (indicado por flechas índigo y azul, respectivamente) que produce un amplicón que representa el alelo A. La especificidad alélica se confiere por un desajuste entre la base 3'-terminal de un cebador interno y la plantilla. Para mejorar la especificidad alélica, también se incorpora en los cebadores internos un segundo desajuste deliberado (indicado por un asterisco) en la posición –2 del extremo 3′. Los cebadores tienen 26 nt o más, para minimizar la diferencia en la estabilidad de los cebadores hibridados con los alelos objetivo y no objetivo, asegurando que la especificidad del alelo resulte de las diferencias en la tasa de extensión, en lugar de la tasa de hibridación. Al colocar los dos cebadores externos a diferentes distancias del nucleótido polimórfico, los dos amplicones específicos de alelo difieren en longitud, lo que permite discriminarlos mediante electroforesis en gel. (http://nar.oxfordjournals.org/content/29/17/e88/F1.expansion )
