¿Hay algún ejemplo en la naturaleza de dos polipéptidos que se unen en un tercer polipéptido único y continuo como este:
(Donde todos los grupos amino y carboxilo indicados están en la cadena polipeptídica principal (ubicada en C α de los respectivos aminoácidos)
Y si esto existe, ¿hay algún término para el fenómeno?
No tengo conocimiento de nada que se corresponda precisamente con su diagrama, pero el comportamiento algo relacionado de inteins puede ser de interés a este respecto. Se definen en Wikipedia como:
Una inteína es un segmento de una proteína que puede escindirse y unirse a las porciones restantes (las exteínas) con un enlace peptídico en un proceso denominado empalme de proteínas.
Por lo tanto, a diferencia de la síntesis de polipéptidos ribosómicos o no ribosómicos (por ejemplo, antibióticos), catalizan un enlace peptídico entre péptidos en lugar de un aminoácido y un péptido. Sin embargo, estos ya forman parte de una sola cadena polipeptídica antes de que la propia inteína se empalme.
[Modificado de Intein_mech.png para ajustarse a la página. — El mecanismo de corte y empalme de proteínas en el que intervienen las inteínas. En este esquema, la N-exteína se muestra en rojo, la inteína en negro y la C-exteína en azul. X representa un átomo de oxígeno o de azufre.]
¿Cuenta el empalme de péptidos en el proteasoma? Los proteasomas normalmente degradan las proteínas en péptidos pequeños, pero el proceso es conceptualmente reversible (los enlaces peptídicos pueden generarse y romperse), lo que conduce al empalme de dos péptidos más pequeños en uno más largo. Hay alguna evidencia de que este es un evento bastante común:
Existen informes de epítopos empalmados generados por proteasoma, pero se han considerado eventos raros. Aquí, sin embargo, mostramos que el conjunto de péptidos empalmados generados por proteasoma representa un tercio de todo el inmunopeptidoma HLA clase I en términos de diversidad y un cuarto en términos de abundancia.
-- Una gran fracción de los ligandos HLA de clase I son péptidos empalmados generados por proteasomas.
gileain
siempre confundido