Intento obtener una imagen del ciclo de vida de una proteína (considerada como una molécula específica).
Así me lo imagino:
Después de que nace la célula, se sintetiza una molécula de proteína por expresión génica por primera vez de novo . Esto sucede en un punto específico en el tiempo y en el espacio, generalmente en un ribosoma, que puede estar ubicado en cualquier lugar dentro de la célula.
Desde el lugar de su generación (combinación o recombinación, véase más abajo), la proteína viaja hasta su destino final, por ejemplo, como un canal iónico en la membrana celular. (Pero posiblemente ya se sintetizó muy cerca de su punto de uso). O simplemente flota en el citosol . (Posiblemente, reúne algunas otras biomoléculas a su alrededor).
Dondequiera que llegue o no: la proteína vive y trabaja durante algún tiempo.
Eventualmente, se daña (= pierde pequeñas unidades funcionales), pero se repara in situ . Continúe con 3.
Eventualmente, se marca con ubiquitina y se destruye de manera controlada. Continúe con 7.
Eventualmente, se descompone espontáneamente (= se divide en algunos fragmentos más grandes).
Sus fragmentos se liberan (en caso de que estuviera unido) y comienzan a flotar nuevamente en el citosol.
Eventualmente, sus fragmentos (o los de otras proteínas) se recombinan (en puntos específicos en el tiempo y en el espacio, posiblemente en "re-fábricas" comparables a las "fábricas" de ribosomas). Continúe con 2.
¿Es esta imagen aproximada del ciclo de vida de una proteína esencialmente correcta?
En caso afirmativo: ¿Qué se sabe sobre los intervalos de tiempo en los que tienen lugar estos procesos? Especialmente: ¿Cuál es la vida efectiva y el tiempo de trabajo de las proteínas típicas? ¿Hay proteínas que viven y funcionan solo minutos u horas y otras que viven meses o años? (¡Ejemplos específicos son bienvenidos!)
Las vidas medias de las proteínas van desde menos de 30 min (p. ej., oxidorreductasas) hasta más de 200 h (p. ej., algunas proteínas de unión a ácidos nucleicos) y hasta, al menos, 2000 h [Rahman & Sadygov, 2017, PLoS One 12( 7): e0180428].
Más sitios de ubiquitinación, vida media más corta; más/más grandes regiones intrínsecamente desordenadas, vida media más corta; más estrechamente acoplado con el ciclo celular, vida media más corta.
Nota: No todas las proteínas eucariotas se degradan a través de la vía proteolítica de ubiquitina-proteasoma.
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0180428
gileain
Hans Peter Stricker
otro 'homo sapiens'
Hans Peter Stricker