Síntesis de ácidos grasos

la imagen 1 (esquina superior izquierda) es la FAS o ácido graso sintasa.  Es la proteína multifuncional que tiene todas las enzimas necesarias en un complejo que consta de 2 monómeros.  (Y por ejemplo, CE es la enzima de condensación).  La imagen 2 (a la derecha) son los pasos que realiza cuando está en la parte de reducción (parte verde en la imagen 1) y la imagen 3 (esquina inferior izquierda) es otro esquema que muestra la condensación, la reducción y la translocación, etc.  Esta última imagen me confunde un poco.

Tengo un problema en mi razonamiento sobre la síntesis de ácidos grasos en el cuerpo humano. En el proceso de síntesis tienes este homodímero.

Entonces, la síntesis comienza con la transferencia de un grupo acetilo de acetil-CoA al grupo sulfhidrilo de la enzima de condensación (CE) con la ayuda de la enzima acetiltransferasa (AT) y esto en 1 de los 2 monómeros.

Al mismo tiempo, un grupo malonilo de la malonil-CoA se transfiere al extremo sulfhidrilo de la fosfopantoteína de la ACP, y esto en el otro monómero y con la ayuda de la enzima maloniltransferasa (MT).

Y AQUI EMPIEZA EL PROBLEMA

El residuo de acetilo se estará condensando con el malonilACP y al mismo tiempo habrá una descarboxilación (se va el CO2) y se va la CE del acetilo. Al final se forma acetoacetil-ACP. Entonces, si lo hice bien; el residuo de acetilo se 'corta' del CE del primer monómero y se une al malonilACP en el otro monómero. ¿Derecha?

Y después de eso, el acetoacetil-ACP volverá al otro monómero (a la parte de reducción), ¿es esto también correcto?

Luego se suceden los pasos de reducción-deshidratación-reducción y al final del camino obtendrá butiril-ACP que se separará del ACP y migrará en el mismo monómero al residuo de cisteína en la enzima de condensación (CE) (= translocación ).

Y después de eso, puede comenzar un nuevo ciclo de condensación-reducción-translocación y continuar hasta que termine en palmitoil-ACP.

Entonces la pregunta real es; ¿Mi razonamiento es correcto acerca de cómo el producto pasa de un monómero a otro varias veces? En mi libro, es una explicación bastante desordenada, por lo que quiero estar seguro de que tengo razón.

Espero que alguien me pueda ayudar =)

Saludos

Podría ser mejor si dibuja un diagrama de su ruta propuesta y lo publica en su pregunta como una edición para que sea más fácil seguir su pregunta.
Tengo algunas fotos al respecto que puedo publicar eventualmente. Intentaré arreglar eso en unos minutos. Si eso no ayuda, lo dibujaré más en detalle mañana y publicaré =)
Me temo que esta imagen es demasiado pequeña... Mañana haré otra.

Respuestas (1)

Las descripciones de los libros de texto sobre la síntesis de ácidos grasos pueden resultar confusas porque, aunque la química subyacente del proceso es universal, la forma en que se organiza es diferente en los sistemas que se han caracterizado, que incluyen E. coli , levadura y vertebrados.

En vertebrados: La ácido graso sintasa es un dímero de polipéptidos individuales multifuncionales idénticos. El proceso de síntesis involucra dos grupos -SH: uno es el grupo terminal del pantotenato del dominio de la proteína transportadora de acilo (Pan-SH) y el otro es un grupo -SH de la enzima de condensación (CE-SH).

Para el primer paso de condensación, el grupo acetilo iniciador se une al CE-SH de un monómero y la unidad entrante (malonil CoA) se une al Pan-SH del otro monómero.

La reacción de condensación entre estos dos da como resultado que la nueva unidad alargada se una al Pan-SH. Luego, esta unidad pasa por los pasos de reductasa/deshidratasa/reductasa para formar el nuevo acil CoA que finalmente se transfiere a un grupo CE-SH, abriendo el Pan-SH para el siguiente malonil CoA entrante.

Esto sucederá repetidamente en cada ciclo del proceso. Obviamente, dado que cada monómero tiene ambos grupos -SH, un solo dímero de ácido graso sintasa puede participar en dos elongaciones al mismo tiempo, pero estas siempre incluirán una transferencia. Se cree que el grupo acetilo iniciador entra a través del grupo Pan-SH.

Tu dices:

Y después de eso, el acetoacetilACP volverá al otro monómero (a la parte de reducción), ¿es esto también correcto? Luego se suceden los pasos de reducción-deshidratación-reducción y al final del camino obtendrá butyrylACP que se separará del ACP y migrará en el mismo monómero al cisteïnresidu en la enzima de condensación (CE) (= translocación).

El diagrama que incluyó muestra claramente que el grupo acetoacetilo se forma a través de los pasos de reducción-deshidratación-reducción en el mismo Pan-SH donde se formó su precursor por condensación. Solo entonces se transfiere al grupo CE-SH. El diagrama también indica que el grupo acetoacetilo se transfiere al CE-SH del mismo monómero. Esto implica que una cadena en crecimiento nunca se transfiere de un monómero a otro. He visto otras fuentes que parecen sugerir que este paso implica una transferencia entre monómeros.

De hecho, de la discusión en la página de WP para la sintasa de ácidos grasos parecería que este es un problema sin resolver; consulte, por ejemplo:

Joshi et al. (2003) Ingeniería de un dímero de sintasa de ácido graso animal activo con solo una subunidad competente Química y biología 10:169 - 173

Abstracto

Las sintasas de ácidos grasos animales son polipéptidos grandes que contienen siete dominios funcionales que son activos solo en la forma dimérica. La inactividad de la forma monomérica se ha atribuido durante mucho tiempo a la participación obligatoria de los dominios de ambas subunidades en la catálisis de las reacciones de carga y condensación del sustrato. Sin embargo, hemos diseñado una sintasa de ácidos grasos que contiene una subunidad de tipo salvaje y una subunidad comprometida por mutaciones en los siete dominios funcionales que es activa en la síntesis de ácidos grasos. Este hallazgo indica que una sola subunidad, en el contexto de un dímero, es capaz de catalizar toda la vía biosintética y sugiere que, en el complejo natural, cada una de las dos subunidades forma un andamio que optimiza la conformación de la subunidad acompañante.

Entonces, si lo hice bien, ¿todo tiene lugar en 1 monómero? ¿Y el paso de translocación también está en el mismo monómero?
Pero, ¿por qué mi libro me dice entonces que la síntesis comienza con la transferencia de un grupo acetilo de acetilCoA al grupo sulfhidrilo de la enzima de condensación (CE) con ayuda de la enzima acetiltransferasa (AT) y esto en 1 de los 2 monómeros y que en al mismo tiempo se transfiere un grupo malonilo de la malonilCoA al sulfhidrilotérmino de la fosfopanteteína de la ACP, y este sobre el otro monómero y con ayuda de la enzima maloniltransferasa (MT)? Claramente me dice que ocurre en los 2 monómeros... Entonces, ¿cuál es la conclusión entonces? =S
Como traté de insinuar, no creo que nadie lo sepa realmente. El documento citado concluye que un solo monómero puede hacer todo, siempre que esté en un dímero. Pero, por supuesto, eso no significa que así sucedan las cosas normalmente. Sin embargo, está claro que la versión predominante de los libros de texto describe la cooperación de dos monómeros, como se muestra en el diagrama 3.
Vale, entiendo lo que dices =) Muchas gracias. Tiene sentido ahora. Seguiré a la maestra en su libro que describe la cooperación de dos monómeros. Porque si yo dijera 'nadie lo sabe realmente' ella diría ¿qué estás tratando de decir? Jaja =P Y sus diagramas muestran que hay una cooperación de dos monómeros como dices, así que también tendré que explicarlo de esa manera en el examen (si ella pregunta). ¡Muchas gracias!