Secuenciación del genoma completo y cromosomas B

¿Las técnicas de secuenciación del genoma completo detectan los cromosomas B si tales cromosomas están presentes?

Mi entendimiento es el siguiente:

La forma en que se mapea el material de ADN en un cromosoma B depende del mapa de referencia y no de cómo se empaqueta el material en los cromosomas para la muestra que se está secuenciando.

¿Es esto correcto?

Respuestas (3)

Puede usar las diferencias en la cobertura (número de lecturas asignadas a ciertas regiones de referencia) para inferir si hay un cromosoma B.

El análisis de la tasa de cobertura de lecturas de NGS puede brindar información sobre el contenido genómico del cromosoma B. Echa un vistazo al artículo mencionado a continuación:

Valente GT et al. (2014). Origen y evolución de los cromosomas B en el pez cíclido Astatotilapia latifasciata basado en análisis genómicos integrados. Mol Biol Evol. 2014 agosto;31(8):2061-72

¿Puede agregar una pequeña explicación sobre cómo se puede usar la cobertura para inferir el contenido genómico del cromosoma B? Una figura ilustrativa de la mención de referencia también serviría. Agradeceríamos mucho alguna explicación además de proporcionar un enlace a la referencia.

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La figura adjunta muestra la cobertura de lecturas de Illumina para dos muestras 0B, dos 1B y una 2B. Tenga en cuenta que la figura muestra regiones genómicas específicas con una mayor cobertura de lecturas para las muestras 1B y 2B en comparación con las muestras 0B.

Bienvenido a Bio. ¿Podría proporcionar las fuentes de sus datos y responder? Se recomiendan las referencias aquí.
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