¿Qué especies han tenido sus genomas secuenciados o están siendo secuenciados?

El proyecto del genoma humano lanzó su primer genoma completo hace casi diez años. Desde entonces también se han secuenciado muchas especies.

Estoy tratando de encontrar una lista de proyectos completados (y posiblemente en curso/iniciados) que secuencian otras especies junto con algunos datos resumidos muy básicos, como el número de genes (divididos entre los cromosomas sexuales y los autosomas), la longitud del ADN, el número de cromosomas, etc. .

Esto es para una presentación que voy a dar en una conferencia y sería una buena adición a mi charla.

"en curso/iniciado" son datos que simplemente no puede recopilar. Hay más proyectos de secuenciación en curso en alguna universidad que no han sido mencionados públicamente (ya menudo no lo serán antes de que estén terminados) de los que estaría dispuesto a contar. Estoy involucrado en al menos 2.

Respuestas (4)

La base de datos GOLD (Genomes Online DB) contiene datos sobre el estado de secuenciación y también algunas estadísticas (número de cromosomas, tamaño del genoma), pero estos datos adicionales no están disponibles para todas las especies.

Hay varias listas en Wikipedia, por ejemplo, para plantas , bacterias y eucariotas .

El proyecto Genome 10K , en sus palabras, "tiene como objetivo ensamblar un zoológico genómico: una colección de secuencias de ADN que representan los genomas de 10,000 especies de vertebrados, aproximadamente una para cada género de vertebrados". Aquí está su lista de especies .

En NCBI, puede encontrar una tabla con la información del genoma por organismo .

Para cada organismo, puedes encontrar el Reino, grupo y subgrupo al que pertenece, el tamaño en Megabases, el número de cromosomas, organelos y plásmidos (si los hay) y el número de ensamblajes.