¿Qué es un dominio de unión al ADN?

¡Bienvenido a Biología.SE!

El término " dominio " en bioquímica y biología molecular suele utilizarse para referirse a una parte de una proteína que tiene una estructura y una función conservadas, es similar entre proteínas relacionadas y, en general, puede existir o funcionar por sí sola si se la separa de la otra. resto de la proteína. Un dominio de unión al ADN es una estructura de proteína que tiene una alta afinidad por el ADN y, por lo tanto, se une a él cuando las dos moléculas están en la misma vecindad. Un ejemplo es un tipo de proteína llamada factor de transcripción , que se une al ADN en el núcleo de la célula (en las eucariotas , las bacterias y las arqueas no tienen núcleo, el ADN simplemente flota libremente) y provoca cambios en la transcripción de los genes. La siguiente imagen deWikiMedia muestra cómo funcionan los factores de transcripción en general.

"Arrollamiento de ADN" es un término muy genérico que describe muchas cosas diferentes. La estructura básica del propio ADN es una espiral, con dos cadenas de azúcar (la desoxirribosa en el ácido desoxirribonucleico o ADN) enrolladas una alrededor de la otra y unidas por bases de ácido nucleico. En la célula eucariota, las hebras individuales de ADN se asocian con proteínas estructurales para crear cromatina , que es lo que forma los cromosomas en el núcleo de cada célula. En la primera etapa, el ADN desnudo se envuelve o enrolla alrededor de proteínas estructurales llamadas histonas.en una estructura llamada nucleosoma. Estos luego se apilan en un "solenoide" o estructura de fibra, que forma la llamada cromatina "relajada", regiones del genoma donde se lleva a cabo la transcripción activa. Si una parte de un cromosoma ha sido marcada como inactiva, o durante ciertos pasos en el ciclo celular cuando una célula se divide en dos ( mitosis ), las fibras se enrollan aún más en cromatina condensada, formando la estructura típica que muchas personas asocian con los cromosomas. Esta imagen, de Wikipedia , visualiza cada paso del proceso.

La palabra "motivo" a veces puede significar lo mismo que dominio; por ejemplo, alguien podría referirse a un "motivo de unión al ADN" en una proteína. Sin embargo, un motivo suele ser más pequeño que un dominio, puede aparecer en el ADN, el ARN y las proteínas, y tiene que ver con la secuencia específica. Un " motivo estructural " en una proteína es algo así como una hélice-bucle-hélice o un giro de horquilla beta que puede aparecer en múltiples tipos diferentes de dominios de proteínas, y no necesariamente tiene exactamente la misma función en esos diferentes dominios, pero típicamente tiene una secuencia bastante conservada que es muy similar. Como ejemplo, el motivo del dedo de zinc se encuentra en los dominios de proteínas que se unen al ADN, al ARN y a otras proteínas.

Toda esta terminología puede ser muy confusa al principio, pero si te apegas a ella, se volverá más fácil con el tiempo. La bioquímica y la biología molecular son campos fascinantes, ¡así que continúa con tus estudios!

De hecho, el dominio y el motivo están relacionados, pero creo que el dominio indica la región en una proteína (o ADN) involucrada en la función (ya sea unión de ADN, catalítica, etc. para unión de proteína / factor de transcripción, etc. para ácidos nucleicos), mientras que el motivo es se utiliza para describir la secuencia particular de bloques de construcción en ese dominio/región. El motivo se utiliza para indicar los aminoácidos particulares que normalmente se encuentran en el dominio de la proteína, pero también para indicar los nucleótidos particulares en una cadena de ADN/ARN.