Parece que las regiones promotoras están escritas desde la dirección 5' a 3'. Mis notas de clase, por ejemplo, dan las secuencias de las regiones promotoras -35 y -10 así:
Wikipedia parece estar de acuerdo en su artículo sobre promotores .
Sin embargo, la ARN polimerasa se transcribe en la dirección 3' a 5', ya que lee la hebra plantilla en la dirección 3' a 5'. En ese caso, ¿por qué las regiones promotoras no están escritas también en la dirección 3' a 5'?
Es decir, en lugar de que la secuencia -10 sea 5'-TATAAT-3'
, ¿por qué no está 3'-ATATTA-5'
de acuerdo con la dirección de la transcripción?
Mi conjetura intuitiva es que el el factor reconoce la región promotora en una direccionalidad de 5' a 3'. Pero no puedo encontrar ninguna información para respaldar esta conjetura. Además, si esto es cierto, ¿ cómo podría haberse determinado (experimentalmente)? Además, cualquiera que sea la respuesta, ¿se aplica también a la transcripción en eucariotas?
La secuencia de ADN, por convención, se escribe comenzando en la posición 5', por lo que se asume la direccionalidad sin escribir explícitamente el 5' y el 3'. En cuanto a por qué no es la secuencia de cadena de plantilla. Diría que también es una convención por simplicidad porque solo necesita escribir una secuencia si quiere hablar sobre genes y elementos reguladores.
David
David
ning