¿Sugerencias para un experimento? [cerrado]

Agradecería sugerencias para mi proyecto de Biología AP de un año. Tal proyecto consistiría en un experimento estándar, que se realizará durante el período de un año, por lo que tendría que ser bastante sustancial.

Estoy interesado en cualquier cosa relacionada con células/ADN/molebio con una conexión matemática. Preferiría algo más que un mero análisis estadístico, tal vez algo como ecuaciones diferenciales.

Tengo acceso a equipos de laboratorio estándar de pregrado; supongamos que soy capaz de conseguir todos los materiales necesarios y que soy capaz de realizar el experimento. Gracias por la ayuda.

Según la sugerencia de shigeta a continuación, hojeé los enlaces y encontré circuitos genéticos interesantes. Entonces, ¿qué es exactamente un circuito genético, cómo se modelan y para qué se usan?

biología de sistemas.. hacer un bioexperimento celular y desarrollar un modelo matemático para el sistema. puedes validar el modelo usando los experimentos..
Realmente necesitas reducir esto. No conocemos sus competencias, los materiales que tiene disponibles, los campos de los distintos laboratorios a los que puede tener acceso, no hay forma de responder a esta pregunta sin un alcance mucho más específico.
Sí, probablemente debería haber sido más específico al respecto; será editado. Estudiaré biología de sistemas.
Todavía va a necesitar un poco más en el lado del equipo. Considero que el cultivo de tejidos es un trabajo universitario estándar porque eso es lo que hice la mayor parte del tiempo en la licenciatura. También he estado haciendo westerns desde la escuela secundaria. Usted menciona células, tiene una forma de cultivarlas, menciona ADN, tiene plataformas de gel y los medios para aislar ADN, y el molebio es tan amplio que en realidad no es limitante.
Sí, tendré acceso a todo lo que mencionaste.
Todavía no estoy seguro de que esta sea una buena pregunta para SE, porque no estoy seguro de que pueda responderse, pero buscaría un experimento de genética avanzada. Puede hacer modelos predictivos y analíticos, e impulsar la genética hacia adelante durante todo un año fácilmente.
Le sugiero que haga la pregunta del circuito genético como una pregunta separada. Y también puede ser específico con eso, como en "¿cómo construiría un experimento con tales y cuales requisitos/recursos para hacer tal y cual con respecto a los circuitos genéticos?"

Respuestas (1)

Esto es un poco difícil: la mayoría de las respuestas posibles aún no te van a gustar, pero te daré tres sugerencias.

Parece que quieres tomar algo con un modelo matemático e intentar modularlo con biología molecular.

Parece poco probable que realmente pueda darle un proyecto específico, pero hay cuatro fuentes que le recomendaré que consulte.

Creo que sugeriría otras suposiciones limitantes:

  1. desea trabajar con E coli; es el organismo más fácil y disponible para trabajar.
  2. desea trabajar con un sistema que esté contenido en un solo plásmido, por lo que depende solo de 2 genes para actuar, 3 en el exterior o tendrá problemas para que todo funcione.
  3. desea un sistema matemático que ya tenga un modelo bien ajustado que perturbará. construir un nuevo modelo podría ser un gran primer proyecto. (pero quién soy yo para decirte qué hacer, estas son solo sugerencias).

La primera sugerencia que tengo es Jeff Hasty en UCSD . Se ha centrado mucho en los circuitos de genes oscilantes. Tiene sistemas simples que podrían ser reproducibles con un pequeño laboratorio, el trabajo más reciente que combina un oscilador GFP con LUX es bastante bueno. Tanto los osciladores como LUX son buenos sistemas independientes para trabajar. . He sido juez de una feria de ciencias y puedo decirles que simplemente reproducir uno de sus sistemas sería una cantidad impresionante de trabajo.

Otro cuerpo de trabajo para mirar es Adam Arkin . Ha analizado muchos candidatos a componentes de circuitos. Artículos como "La búsqueda del transistor biológico" pueden hacerle pensar. Este es un cuerpo de trabajo más amplio, por lo que puede tomar un tiempo obtener una idea de él.

En tercer lugar, si esto le resulta aburrido y quiere mirar más ampliamente, puede mirar a través de las competiciones iGEM . Estos son proyectos con osciladores y sistemas de biosíntesis que a veces tienen asociados modelos matemáticos. La gran ventaja aquí es que es posible que pueda comenzar o unirse a un equipo iGEM y luego algunos o todos los plásmidos ya estarán hechos: mol bio se vuelve muy costoso si alguien no le regala algunos materiales.

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