Optimización de la electroforesis en gel: amperios, voltios y concentraciones de tampón

Soy un estudiante de maestría en bioquímica y he usado la electroforesis en gel muchas veces antes. Lo que quiero saber es cómo se debe ajustar el mA (mamperio) en comparación con el voltaje y el búfer que se usa.

Normalmente utilicé tampón 1xTAE (ejecutado a 90 V) o tampón de borato de sodio 1x (ejecutado a 110 V). Sé que si ajusto el voltaje hacia arriba, el tampón se calienta más rápido, las muestras viajan más rápido, pero la "imagen" del gel se vuelve más borrosa. Sin embargo, esto es todo lo que sé sobre ajustar el parámetro.

Así que mis preguntas se pueden resumir en las siguientes:

  1. ¿Cómo debo ajustar el amperaje? ¿Hay algún rango en el que deba estar en comparación con el búfer o la muestra que estoy ejecutando?

  2. ¿El amperaje afecta la velocidad de viaje si se ajusta hacia arriba o hacia abajo?

  3. ¿Puedo ajustar la concentración del búfer para analizar la muestra a un voltaje más alto? ¿Qué efectos tendrá esto (para aumentar o disminuir la concentración)?

  4. ¿Existe una relación entre el amperio y el voltaje que puedo manipular, en este caso: cómo y por qué?

Esta página de Thermofisher también ofrece muchos consejos para la optimización: thermofisher.com/se/en/home/life-science/pcr/…

Respuestas (1)

  1. Por lo que sé, puede ajustar el amperaje o el voltaje, ya que ambos dependen de la resistencia del búfer. Lo que significa que le sugiero que deje el voltaje como está.

  2. Como el amperio = voltaje / resistencia y el voltaje = resistencia * amperio y como pueden ver, el voltaje tiene que aumentar si aumenta el amperio y el amperio tiene que aumentar si aumenta el voltaje (al menos si lo entiendo bien ) la velocidad de desplazamiento debe aumentar cuanto mayor sea el amperaje establecido.

  3. No disminuiría ni aumentaría la concentración del tampón. Tal vez usar fácilmente otro tipo de búfer te ayudaría. Pero esto depende de las diferentes muestras que esté ejecutando. Tal vez eso podría ayudarlo: Brody, JR y Kern, SE (2004). Historia y principios de los medios conductores para la electroforesis de ADN estándar. Bioquímica analítica 333, 1–13.

  4. La resistencia está más o menos dada. Por lo tanto, que yo sepa: No.