Las células bacterianas no están compartimentadas internamente con membranas (como los eucariotas). Esto conduce naturalmente a una imagen de un interior homogéneo, pero el citoplasma bacteriano no es homogéneo. Por ejemplo, el ADN está localizado en el nucleoide. Si la célula se toma la molestia de poner todo su ADN en un solo lugar, tener polimerasas de ARN en todas partes sería un desperdicio (incluso contraproducente). Entonces, ¿es la imagen más intuitiva de las bacterias, con RNAPols por todas partes, verdad? ¿O están localizados? ¿Si es así, cómo?
Si la especie importa, hablemos principalmente de E. coli .
En E. coli, la mayoría de las moléculas de ARN polimerasa están unidas al ADN, y las que no lo están están al alcance del ADN.
Una célula típica de E. coli contiene alrededor de 5000 moléculas de ARN polimerasa. Cuando las células crecen rápidamente, 2500 moléculas se unirán a genes en complejos de transcripción. Otros 1250 estarán en complejos de iniciación de varios tipos y la mayoría de las moléculas de ARN polimerasa restantes (1200) estarán unidas al ADN de forma no específica. Solo un pequeño número (~50) estará libre en el citoplasma.
Los números que cita para el número de moléculas de polimerasa y la proporción que participan en la transcripción concuerdan razonablemente con los valores disponibles en Bionumbers . Entonces parece que la mayoría de las moléculas de ARN polimerasa estarán ubicadas en el nucleoide; cualquier molécula que esté libre en el citoplasma está al alcance de la mano para encontrar un sitio de unión al ADN, ya que una proteína típica puede difundirse por toda una célula de E. coli en 10 ms. ( Bionúmeros )