¿Cómo puede E. coli proliferar tan rápidamente?

La E. coli tiene un genoma de aproximadamente 5x106 pb . La principal ADN polimerasa involucrada en su duplicación cromosómica (DNA pol III, la de mayor procesividad) puede polimerizar ~ 10 3 nucleótidos por segundo. Mediante un simple cálculo, concluiríamos que la duplicación del cromosoma completo tomaría ~ 5000 segundos (alrededor de 80 minutos, más de una hora ). La duplicación de toda la célula probablemente requeriría mucho más que eso, considerando que no solo está involucrada la DNA Pol III. Sin embargo, en condiciones óptimas, E. coli puede duplicarse en ~ 30 minutos . ¿Cómo podría ser eso posible?

OBS.: todos los números utilizados aquí son aproximados, pero suficientes para dar cuenta de los órdenes de magnitud correctos.

En las bacterias solo hay uno (oriC), ¿no?
La replicación está ocurriendo en varios puntos al mismo tiempo.
Me retracto de mi anterior comentario incorrecto. annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev.ge.26.120192.002311 parece sugerir que solo hay un origen de replicación en E. coli.
Tenga en cuenta que la replicación procede en ambas direcciones desde oriC, por lo que, según sus cálculos, la replicación del ADN tarda 40 minutos (que aún es demasiado tiempo). La solución es comenzar la replicación nuevamente antes de que se complete la ronda anterior. ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2063475
¡Esta es una excelente respuesta canadiense! ¿Por qué hay una respuesta tan buena en la sección de comentarios? ; )
@CDB Gracias. Estoy un poco ocupado, pero publicaré una respuesta más tarde si puedo.
Agregando al comentario de @canadianer: en cualquier momento, el genoma de E.coli no es exactamente haploide. El número de copias es mayor que uno. El cromosoma se parece un poco a un anillo de bodas. Canadianer, deberías convertir ese comentario en una respuesta.
Larry Moran tiene una buena descripción del proceso, completa con diagramas, en su blog: sandwalk.blogspot.com/2008/05/…
organismo simple. Mire lo que el equipo de craig ventures ha podido hacer con el genoma de E. coli

Respuestas (2)

Aunque Escherichia coli tiene solo un origen de replicación (oriC), la replicación procede en ambas direcciones a partir de él. Por lo tanto, según sus cálculos, la replicación del ADN tarda 40 minutos (que sigue siendo demasiado tiempo si el tiempo de duplicación es de 30 minutos). La solución es comenzar la replicación nuevamente antes de que se complete la ronda anterior, y aquí hay algunas investigaciones que muestran exactamente eso:


Yoshikawa H, O'Sulliven A, Sueoka N. 1964. Replicación secuencial del cromosoma Bacillus subtilis . Prod Nat Acad Sci 52:973-980

Obviamente, la replicación dicotómica es ventajosa para el crecimiento bacteriano porque las bacterias pueden replicar los cromosomas más rápido que si tuvieran un punto de replicación. Con un punto de replicación, el tiempo de replicación y, en consecuencia, el tiempo de generación celular estaría limitado por la tasa máxima de ADN polimerasa.


Cooper S, Helmstetter CE. 1968. Replicación cromosómica y ciclo de división de Escherichia coli B/r. J Mol Bio 31(3):519-540

…las células que crecen más rápido que 40 minutos por duplicación deben iniciar nuevos puntos de replicación antes de completar la síntesis de ADN en los puntos anteriores; en otras palabras, debe haber múltiples bifurcaciones.


Skarstad K, Boye E, Steen HB. 1986. Momento del inicio de la replicación cromosómica en células individuales de Escherichia coli. EMBO J 5(7):1711-1717

En cultivos de rápido crecimiento, con replicación paralela de varios cromosomas, las células terminarán con 2n (n = 1, 2, 3) cromosomas si la iniciación ocurre simultáneamente en todos los orígenes. Un cultivo con iniciación asíncrona puede contener además células con números irregulares (distintos de 2n) de cromosomas. La frecuencia de células con números irregulares de cromosomas es una medida del grado de asincronía de iniciación.


Fossum S, Crooke E, Skarstad K. 2007. Organización de orígenes hermanos y replisomas durante la replicación de ADN multifork en Escherichia coli. EMBO J 26(21):4514-4522

…la iniciación ocurre en dos orígenes en la célula 'madre'. Incluso puede ocurrir en la célula 'abuela' en cuatro orígenes si el tiempo que se tarda en replicar y segregar el cromosoma supera las dos generaciones.

ingrese la descripción de la imagen aquí

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Esta última imagen es interesante porque en realidad se ven múltiples orígenes de replicación en células individuales mediante microscopía de fluorescencia.

Las tasas de división celular pueden exceder las tasas de replicación del ADN, porque la replicación del ADN puede ocurrir en paralelo , mientras que la división celular siempre es en serie. En un cromosoma circular como E. coli, la replicación comienza en el origen de la replicación. Una vez que se replica el origen, allí se puede iniciar otra replicación cromosómica, mientras que la anterior ni siquiera ha terminado. Por lo tanto, esta replicación paralela permite que las tasas de división celular excedan las velocidades de duplicación cromosómica.

replicación bifurcada
Replicación bifurcada en E. coli . Fuente: Fossum et al . (2007)

Referencia
: Fossum et al ., Revista EMBO (2007); 26 : 4514–22