¿Cómo puede E. coli afectar la expresión de C. elegans?

Los plásmidos se pueden transferir a E. coli . Estos E. coli transformados se pueden alimentar a C. elegans para silenciar su expresión génica por ARNi.

¿Cómo puede E. coli liberar ARNi a C. elegans ? Incluso si asumimos que E. coli podría ingresar a las células de C. elegans por ser bacterias intracelulares, es difícil imaginar que el ARNi saldrá directamente de E.coli y entrará en las células de C.elegan . ¿Normalmente, ninguna célula o bacteria liberará ARN o material genómico fuera de sus células?

@Chris ¿Hay alguna forma de fusionar esta pregunta con esta biology.stackexchange.com/questions/38586/… ? Si bien son preguntas duplicadas, ¿esta hace la pregunta de una manera más clara y precisa?
"¿Normalmente, ninguna célula o bacteria liberará ARN o material genómico fuera de sus células?" Transferencia horizontal de genes en bacterias. Sistema inmunitario humano Neutrófilos y trampas extracelulares de neutrófilos...
Esta publicación proporciona información adicional sobre cómo C. elegans absorbe dsRNA

Respuestas (1)

Sí, por extraño que parezca, eso es lo que sucede. La E. coli expresa una horquilla de ARN de doble cadena (bajo la regulación de un promotor inducible), y el ARN contiene una secuencia derivada de un gen de C. elegans . Cuando los gusanos comen las bacterias, las muelen en la faringe y liberan el contenido de las células (incluido el ARN inducido) en el intestino de los gusanos. Las células intestinales pueden absorber el dsRNA y transportarlo también a otras células. La vía de ARNi procesa los ARN inhibidores para regular a la baja el gen objetivo.

¡Eso es sorprendente! +1. Intenté editar la pregunta. ¿Podrías comprobar si está bien? No es realmente mi experiencia.
También puede agregar una nota sobre los transportadores de ARN en C.elegans ( Sid1/2 ). Aunque no estoy seguro, supongo que C.elegans (o quizás organismos relacionados) expresa estos transportadores más que otros organismos que conocemos.
@WYSIWYG Ilan y tú habías dado una respuesta similar a una pregunta mía sobre c.elegans. Creo que mi pregunta puede fusionarse con esta. (no puedo proporcionar el enlace... usando la aplicación)
En primer lugar, las células intestinales pueden absorber el dsRNA, ¡pero estamos hablando de las células de todo el cuerpo en C.elegans! Si transformamos el RNAi de EGFP, silenciará el EGFP de todo el cuerpo... ¿o no? En segundo lugar, ¿la E.coli o la C.elegans producen ARNi? No estoy hablando de dsRNA. Si C.elegans produce ARNi, significa que C.elegans debe absorber la liberación de dsRNA de E.coli. Hasta donde yo sé, el dsRNA podría ser más grande que las proteínas... ¿es posible absorber el dsRNA directamente? Y también, volviendo a la primera pregunta, ¿cómo puede el dsRNA pasar a todo el cuerpo de C.elegans para silenciar la mayoría de los genes de las células en todo el cuerpo?
@RogerL. Está confundiendo el término RNAi, que es un mecanismo regulador biológico que degrada el mRNA, con dsRNA pequeño, que puede desencadenar la vía RNAi. Las bacterias sintetizan el dsRNA, y este se libera cuando la bacteria muere. Las células de C. elegans absorben o incorporan los dsRNA sintetizados por bacterias Y contienen transportadores que propagan el dsRNA entre células adyacentes. Así que sí, el EGFP expresado en el músculo de la pared corporal será silenciado por el dsRNA ingerido en el intestino. El complejo RNAi existe en todas las células de gusano.
Dos genes de gusanos que regulan otros genes de gusanos que utilizan esta vía son let-2 y lin-4 . No codifican proteínas; codifican pequeños ARN de interferencia que se unen a ARNm maduros de otros genes, genes que codifican proteínas. Una vez que la transcripción de lin-4 se une a su objetivo complementario, el dsRNA desencadena la vía de degradación del RNAi. También puede inyectar dsRNA en gusanos (pero requiere mucha mano de obra), o puede sintetizar dsRNA in vitro y simplemente sumergir a los animales en él para obtener el mismo efecto que alimentarlos con bacterias modificadas.
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