¿Están disponibles los datos originales de difracción de rayos X?

En muchos casos están disponibles. Uno de los principios básicos del Banco de Datos de Proteínas (PDB) fue almacenar no solo los modelos (posiciones e identidades atómicas) de macromoléculas y proteínas, sino también los datos de rayos X de origen, más recientemente en factores de estructura.

Si la pregunta es 'por qué están dando solo los factores de estructura y no los datos originales que tomaron', tal tarea requeriría mucho esfuerzo de curación para muy poco beneficio científico. Escalar los conjuntos individuales de datos del detector solía ser una tarea complicada. La estructura original de la mioglobinasupondría películas escaneadas en un formato antiguo de los años 50. Nadie podría usar eso ahora sin piratear el formato de la imagen, si no fuera en cinta de papel o tarjetas. De hecho, en ese caso los factores de estructura no están disponibles. Escalar muchas o varias recopilaciones de datos juntas a menudo se hacía con ajustes personalizados en los años 70 y luego, en los años 90, la recopilación de datos se volvió más rutinaria, pero varias generaciones de detectores de rayos X se hicieron populares y luego desaparecieron del mercado. Cada uno tenía sus propias excentricidades y requisitos para combinar conjuntos de datos de múltiples lecturas.

El propósito de tener factores de estructura disponibles es permitir que cualquier persona reconstruya la densidad de electrones y evalúe el acto interpretativo que es rastrear un péptido a través de la densidad de electrones. Dado que ese formato es principalmente independiente del detector y ha sido bastante consistente a lo largo de los años, ofrece una cantidad significativa de valor científico por el dinero.

Si desea datos de imágenes sin procesar o datos patentados del detector antes de múltiples conjuntos de datos de diferentes cristales antes de que se combinaran, deberá comunicarse con los autores, quienes probablemente tendrán que examinar un mar de DVD para llegar a ellos. En casos más antiguos, podrían ser cintas.

En cuanto a los factores de estructura, que son esencialmente el valor de la raíz cuadrada de los datos de intensidad combinados y escalados, están disponibles y forman parte de cada envío al pdb:

Busque en cualquier página de estructura de rayos X en RCSB. Por ejemplo este .

Hay un cuadro llamado "Detalles experimentales" y puede descargar los factores de estructura allí haciendo clic en un enlace.

Si está buscando más de uno a la vez, hay descargas masivas disponibles a través de su página de descarga . Marque la casilla "Factores de estructura". Los datos de intensidad sin procesar también deberían estar disponibles si los busca.

Sugerencia adicional : estaba pensando que si observa el software de escalado que viene con los detectores de rayos X, podría encontrar algunos tutoriales con datos sin procesar sin escalar. Encontré un ejemplo en Marresearch : lisozima de clara de huevo de gallina.