¿Cuál es la diferencia entre los *tipos* de enzimas de disociación de tejidos?

Estoy tratando de disociar un tumor, y la mayoría de los protocolos como NCI/NIH recomiendan un stock de digestión de enzima triple 10X que consta de: colagenasa tipo IV, DNasa I tipo IV y hialuronidasa tipo V en HBSS. Esto se remonta a los años 90, y la receta varía según los papeles (dispase, papaína, proteasa neutra, elastasas, etc.). Sin embargo, la supuesta receta oficial que se me ha encomendado usar se compone de lo anterior, principalmente de Sigma-Aldrich (C5138, D5025, H6254)

Sin embargo, realmente no puedo encontrar nada que diga cuáles son las diferencias reales entre estos tipos de enzimas. O por qué, por ejemplo, la ADNasa tipo IV funciona mejor que la tipo II, y así sucesivamente. ¿Es tal vez que la receta se quedó pegada?

Respuestas (1)

Han pasado años desde que miré un catálogo de Sigma (antes de que se convirtiera en Sigma-Aldrich) pero, según recuerdo, estas designaciones son propiedad arbitraria que utiliza Sigma para distinguir diferentes fuentes; el punto clave es que Sigma generalmente no fabricaba todos estos ellos mismos, pero obtenidos de terceros.

El otro punto a tener en cuenta es que estas preparaciones de enzimas generalmente eran/son impuras, pero en diferentes grados, por lo que las designaciones de tipo le permitieron volver a pedir una preparación particular que funcionó, y también especificar el grado real que usó cuando lo publicó. que otras personas puedan repetir tu trabajo. Sin duda, los grados más caros también funcionarían en el tipo de aplicación rudimentaria que describe, pero sería una pérdida de dinero.

Pensé que los catálogos solían darte alguna información (organismo/tejido al menos), pero, como dije, ha pasado mucho tiempo (aunque ojo con tu “camino de vuelta a los 90”, jovencito).

Independientemente de su edad, 17 años es una cantidad de tiempo bastante significativa. Viejo pedo.
Esto es algo de lo que estoy sacando de su catálogo. Vi una fuente que decía algo así como DNase IV funciona mejor en ADN que contiene muchas repeticiones, pero no pude encontrar nada más que lo respalde. Costo versus actividad/pureza parece ser el caso.
Y para ser justos, leer "Cancer Research 54" alrededor de 1994 es un poco como leer un libro de historia sobre terapias basadas en células T.
Pero hay algunas cosas de esa cosecha y anteriores que apenas se han agregado desde entonces, especialmente en áreas muy químicas. Estaba tratando de encontrar información (para una pregunta de SE Biology) sobre la conformación de anillos de azúcar en diferentes hélices y tuve que caminar hasta la biblioteca para publicar un libro en los años 80.