Estoy escribiendo una propuesta de subvención, y parte de la investigación involucrará la secuenciación y comparación del ADN de árboles en Estados Unidos y Japón. ¿Cómo se analiza el genoma de un árbol y se compara con un conespecífico?
En artículos de revistas, están haciendo muchos estudios cada año que describen las herramientas y los procedimientos más avanzados para secuenciar genomas de plantas.
investigando 5 minutos tienes resultados de este tipo:
http://www.pnas.org/content/95/16/9693.full
Los protocolos incluían kits comercialmente disponibles (p. ej., RNeasy Plant Minikit de Qiagen), protocolos de laboratorio de extracción de ARN no comerciales (p. ej., CTAB, fenol ácido) y métodos híbridos que combinaban componentes de kits comerciales y protocolos de laboratorio. Los protocolos detallados utilizados para todos los aislamientos están disponibles en línea en el Apéndice S1. http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0050226
Las muestras de tejidos y órganos para el análisis de Northern blot de los patrones de expresión génica se tomaron durante la temporada de crecimiento y se congelaron en nitrógeno líquido, luego se almacenaron a -80 °C. Las muestras de las puntas de los brotes son los 1–2 cm terminales de tejido de tallo suculento de ramas alargadas y líderes terminales. El xilema inmaduro se cosechó con un pelador de vegetales de la superficie de los tallos leñosos después de retirar la corteza, e incluye células con paredes celulares primarias derivadas de la zona cambial a través de la zona de expansión celular radial. Los ARN de xilema inmaduro de madera de compresión y de madera lateral fueron los que se usaron para la preparación de las bibliotecas, mientras que el xilema inmaduro vertical denota muestras tomadas de tallos de árboles de control que crecen verticalmente. El tejido descrito como "floema" se recolectó de la superficie interna de la corteza de tallos verticales y en realidad incluye periderma y otros tejidos, así como también floema activo. Se recogieron cepillados de la superficie de tallos leñosos verticales con un cepillado de madera después de cosechar xilema inmaduro e incluyen células que han formado paredes celulares secundarias lo suficientemente fuertes como para resistir la cosecha por parte del pelador de verduras. Las muestras de agujas eran agujas juveniles parcialmente expandidas.
Aquí hay algunos textos más para que los revises.
http://www.pnas.org/content/106/31/12794.full
https://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2148-7-214
Me tomó 5 minutos encontrar esta información buscando artículos para
métodos de secuenciación de plantas
aaaaa dice reincorporar a Monica
ian
John
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RM