¿Cómo puedo hacer la transición a la edición del genoma después de un doctorado en física teórica?

Tuve una experiencia de doctorado muy mala que me ha llevado a una pérdida total de motivación para seguir una carrera en física teórica. Ya no tengo la motivación para trabajar en temas que son muy abstractos y, siendo un postdoctorado, es aún más difícil hacerlo de forma independiente. Además, encuentro muy oscuras las perspectivas a largo plazo de hacer esto. No hay buenas oportunidades de trabajo y obtener un puesto de tenencia requiere más de una experiencia posdoctoral.

Hasta tarde, he estado pensando en hacer la transición a la biología y más específicamente al campo de la edición del genoma. Sé que esto es muy diferente de lo que me han enseñado, pero siempre me ha gustado este campo y estudié mucho por mi cuenta durante mis años de posgrado. Antes de contactar a la gente, pedí consejo si esta transición es factible o práctica. Y todos los que respondieron me han animado fuertemente a seguir adelante.

Pero fue una historia diferente cuando se trataba de conseguir un puesto (también pedí oportunidades de pasantías) en el laboratorio. El consejo era meterse en biología computacional donde la gente interdisciplinar es más.

No quiero hacer la transición a la biología computacional solo porque sería más fácil, sino aprender habilidades completamente nuevas. De lo contrario, hubiera preferido capacitarme con dedicación en ciencia de datos y encontrar trabajos corporativos bien remunerados. Quiero seguir investigando y hacer un trabajo impactante, algo con impacto real y no esotérico como mi trabajo de posgrado o posdoctorado.

Dada la situación, he estado pensando en hacer otro doctorado porque no tengo limitaciones. Pero me temo que esto no es recomendable y dudo que me admitan en buenos lugares. ¿Debo conocer en persona a las personas cuyo trabajo admiro o tener una discusión en línea con ellos si eso es posible? La mayoría de las historias de transición que he escuchado involucran algún tipo de reunión durante conferencias/reuniones y las cosas se acomodaron después de eso. Cualquier tipo de consejo útil teniendo en cuenta mis intereses sería muy apreciado.

Un paso a la vez.
Comience con un año más o menos de trabajo de laboratorio húmedo, un programa de maestría lo obtendrá, luego continúe desde allí. Querrá comprender la teoría, los objetivos y la práctica.
Existe al menos un grupo de investigación que se dedica tanto a la física teórica de la materia condensada como al trabajo biológico de laboratorio húmedo (aunque no específicamente a la edición del genoma). Me pregunto si un lugar así podría ser un buen lugar para que OP pase un período de transición.
Como alguien en las ciencias del genoma, puedo decir anecdóticamente que hay un número creciente de doctores en física que encuentran un gran éxito en las ciencias biomédicas/bioingeniería. Tome a Stephen Quake como modelo: bioengineering.stanford.edu/person/stephen-quake
Sé que la gente a menudo dice que no haga dos doctorados, pero en un par de casos he visto que es el movimiento correcto y funciona muy bien. En tu caso, creo que podría ser el camino a seguir. La biología se ha vuelto tan fascinante en estos días que es completamente comprensible querer cambiar de campo.

Respuestas (2)

A riesgo de ser franco, probablemente valga la pena señalar que existe una diferencia entre "querer un trabajo en un área específica" porque desea hacer la transición a esa área y "estar realmente calificado para un trabajo en esa área".

En otras palabras, una evaluación honesta de la situación es probable que nadie le dé un trabajo remunerado en un laboratorio de genómica porque no tiene los antecedentes para tal trabajo: las personas que quieren contratar como, por ejemplo, postdoctorados han tenido varios años de capacitación y experiencia laboral en esta área, y no lo hace. Eso es solo un hecho, independientemente de si ha realizado o no un autoestudio en el área. Así que estás atascado esperando que ese unicornio aparezca de la nada.

La receta para conseguir realmente estos trabajos es obtener las calificaciones necesarias para estos trabajos. No obtendrá esta calificación a través del autoaprendizaje: está compitiendo con personas que han pasado varios años en el banco de laboratorio durante sus doctorados. Tendrás que pasar por esa escuela también. Así que solicita programas de posgrado. Por supuesto, es posible que encuentre el mismo problema: les gustaría contratar personas como estudiantes graduados que hayan tenido varios años como estudiantes universitarios de biología; si conoce a alguien en los departamentos de biología, es concebible que pueda encontrar formas de demostrarle que tiene un conocimiento equivalente y encontrar la admisión de todos modos.

En cuanto a su último comentario, "La mayoría de las historias de transición que he escuchado involucran algún tipo de reunión durante conferencias/reuniones y las cosas se acomodaron después de eso".: Este tipo de casos son primero raros, segundo probablemente exagerados (la persona en hecho, ya tenían bastante experiencia en biología, aunque podrían haber tenido un puesto en un departamento de física), y en tercer lugar, a menudo involucran a personas que en realidad no están buscando un puesto remunerado: por ejemplo, ya son profesores de física y simplemente se encuentran en colaboraciones con biólogos. No creo que este sea un camino viable para que llegues de donde estás a donde quieres estar. No hay alternativa a estar realmente calificado para el trabajo que está buscando.

Realmente no es nada raro en el caso específico de la bioinformática: este es un campo muy interdisciplinario, y además relativamente nuevo. Hasta hace muy poco, todos los que trabajaban en bioinformática procedían de diferentes campos. En el laboratorio en el que hice mi doctorado, teníamos gente que venía de biología, informática, matemáticas puras, física, incluso ingeniería aeronáutica.
@terdon 'Hasta hace poco, todos los que trabajaban en bioinformática procedían de diferentes campos' Depende de cómo se defina "muy recientemente". Un bioinformático muy famoso me dijo en 2004 que la contratación de graduados en Física para roles en Bioinformática se había vuelto bastante raro porque, en ese momento, había muchos graduados en Bioinformática en el mercado laboral. (Pero en cualquier caso, la bioinformática parece no estar donde se encuentran los intereses de OP).
@DanielHatton Bueno, comencé mi doctorado en 2002 y en ese momento, había muy pocos cursos de bioinformática de pregrado, si es que había alguno, y la mayoría de las personas en el campo provenían de diferentes orígenes. Hubo algunos cursos de posgrado, aunque no muchos, pero muy, muy pocos de pregrado. Por supuesto, eso también dependerá de la región geográfica. Estoy mayormente familiarizado con el mundo de la bioinformática europea.
@terdon La conversación que describí tuvo lugar directamente en el corazón del mundo europeo de la bioinformática. Es posible que el famoso bioinformático en cuestión solo estuviera buscando desesperadamente una manera gentil de hacerme saber que no conseguiría un trabajo por ese camino, en lugar de intentar una descripción completamente precisa del mercado, pero siempre me han llamado la atención. como demasiado directo para permitirse ese tipo de cosas.
@DanielHatton No sé qué decirte. Les puedo asegurar que hay muchos en el campo cuyos doctorados fueron en Física. No puedo saber por qué este "famoso bioinformático" te dijo lo que hizo, tendrías que preguntarles. También recuerde que este es un campo muy amplio y estoy seguro de que algunos subcampos serán diferentes a otros. Y, finalmente, mi relato es claramente anecdótico: no puedo descartar que me haya cruzado con más personas con formación en Física debido a las conferencias a las que asisto y los lugares en los que he trabajado.
@DanielHatton, ¿ha cambiado la situación de los licenciados en física en bioinformática desde 2004? Me imagino que el auge del aprendizaje automático podría haber marcado alguna diferencia en los últimos 10 o 15 años. Sólo curioso.
@JW Muy posible. No lo he estado monitoreando de cerca.
Trabajo para una empresa de bioinformática y hemos contratado doctores en física hace apenas 2 años. Todavía estamos reclutando activamente personas de matemáticas y física.
@terdon Te estás perdiendo la marca. OP específicamente no quiere dedicarse a la bioinformática, sino a la edición del genoma. Diferente campo, para el cual son necesarios diferentes antecedentes.
@WolfgangBangerth sí, lo sé. Había entendido mal la pregunta.

Primero, un ligero replanteamiento: si su decepción con la física teórica es que es demasiado abstracta y quiere hacer un "trabajo impactante", tal vez considere oportunidades fuera de la academia también. La investigación académica hace un buen trabajo de relaciones públicas al venderse a sí misma como la organización sin fines de lucro, idealista, que hace del mundo un lugar mejor en contra de la industria, pero en mi experiencia, la mayoría de la investigación académica es bastante introspectiva y ofrece relativamente poca recompensa. a cualquiera que no esté movido por la propia curiosidad científica. Así que mire también la física médica (¡que puede ser de investigación o clínica!), la industria relevante, la ciencia de datos, etc.

Si está decidido a permanecer en la academia, una cosa que debe tener en cuenta es que muchos de los laboratorios de biología que podrían estar interesados ​​​​en contratar a alguien con experiencia en física "listo para usar" lo harían esperando que usted traiga física . pericia. Si su experiencia negativa es con la física teórica académica, esto puede funcionar bien para usted, pero si realmente le ha disgustado la física y/o quiere hacer un trabajo fundamentalmente diferente, entonces podría ser muy frustrante ser la "mascota". físico" mientras todos los demás están haciendo el trabajo de biología más tradicional que esperabas hacer.

Básicamente, debe tener algo que ofrecer al laboratorio que lo contrata: ya sea su experiencia en física / aritmética (por ejemplo, como un rol de científico de datos), o como biólogo por derecho propio. En el último caso, como identifica correctamente, en realidad no está calificado, y obtener algunas calificaciones relevantes ayudaría tanto a su CV como a su comprensión de las ciencias de la vida (probablemente comenzaría con una maestría en lugar de un doctorado, especialmente si tiene acaba de salir de una experiencia negativa de doctorado).

Y, como señala @terdon, la "edición del genoma" no es realmente un campo de la biología. En el mejor de los casos, es una técnica: hay un puñado de laboratorios que trabajan en la tecnología en sí, pero la gran mayoría de las personas usan la transgénesis/CRISPR/lo que sea como una herramienta en la búsqueda de una pregunta biológica. Este es un problema común que he visto en personas con experiencia en ciencias duras: a menudo tienden a estar interesados ​​o son conscientes de solo unos pocos problemas técnicos o abstractos de alto perfil que en realidad son bastante poco interesantes desde una perspectiva biológica (todos los campos). son propensos a esto, no solo la biología...). Si quieres trabajar como biólogo, entonces tener algunos antecedentes académicos relevantes lo ayudaría a comprender en qué están trabajando sus colegas y por qué es interesante. Absolutamente no tienes que cambiar tus propios intereses o preferencias. Pero colocar su interés específico, que puede ser la edición del genoma, en una comprensión más sólida del problema biológico que está tratando de resolver lo ayudará a establecer conexiones con una gama más amplia de personas y alinear su trabajo con resultados realmente útiles.