¿Cómo puede la poliadenilación del extremo 3' proteger al ARN celular de la degradación por ribonucleasas?

De acuerdo con mi libro Molecular Biology Principles of Genome Function de Craig et al, la degradación del ARN eucariótico no tiene un inicio, como en las bacterias, donde la pirofosfato hidrolasa hidroliza el 5'-trifosfato a 5'-monofosfato y, por lo tanto, es el iniciador.

En eucariotas, la cola poliA se acorta por un complejo enzimático de deadenilasa que contiene una exonucleasa de 3' a 5' llamada CCR4. Pero la deadenilación de la cola poliA no tiene por qué conducir necesariamente a la degradación, ya que es reversible mediante la readenilación postraduccional.

La cola poli A protege el ARNm al no permitir que las nucleasas lleguen al ARNm mismo. Siempre que la cola de poli A se degrade, está bien, ya que puede readenilarse nuevamente. La siguiente figura muestra la degradación del ARNm en eucariotas, que puede ser en dirección 5' a 3' o en dirección 3' a 5'.

Lo que está pensando es en la ubiquitinación de proteínas, que es un proceso postraduccional que puede marcar las proteínas para su degradación.

En realidad, si la poliadenilación protege un ARNm o lo hace susceptible a la degradación depende del organismo. De Dreyfus y Régnier 2002 :

En eucariotas, las colas de poli(A) suelen actuar como estabilizadores de ARNm intactos, mientras que en E. coli sirven para acelerar la destrucción de fragmentos.

Esto se debe a diferentes mecanismos de protección en procariotas y eucariotas:

La proteína de unión a poli(A) (PABP) inhibe la deadenilación en ensayos libres de células de mamíferos. Aunque las proteínas de unión a poli(A) también existen en E. coli y aunque pueden proteger las colas de poli(A) contra la PNPasa in vitro (Feng et al., 2001), es posible que no puedan ejercer una protección significativa in vivo porque la poli (A) las colas nunca crecen lo suficiente como para permitirles unirse.

Es importante tener en cuenta que la degradación del ARNm bacteriano generalmente comienza internamente , en contraste con la degradación del ARNm eucariótico que ocurre (¿exonucleóticamente?):

Como se señaló anteriormente, otra característica distintiva de las bacterias es el hecho de que la poliadenilación generalmente afecta solo la degradación de fragmentos, porque el ataque inicial en la mayoría de los mRNA intactos es endonucleolítico.

Todas estas citas provienen de la revisión a la que hice referencia en la parte superior de mi respuesta, recomiendo leerla ya que es muy completa (e interesante).