Recientemente he estado involucrado en colaboraciones que me exigen modelar la genética de poblaciones de poblaciones eucariotas. Me temo que puedo estar "reinventando la rueda" o cometiendo errores conceptuales (por ejemplo, simplificando suposiciones) en muchas de las técnicas y decisiones hasta ahora.
Agradecería mucho recomendaciones de libros sobre genética poblacional/evolutiva o microevolución para lidiar con estos miedos. Los criterios preferibles son:
Introduce intuitivamente los conceptos clave.
Énfasis en modelar con ejemplos de problemas y sus soluciones.
Relativamente corto (planeo leerlo de cabo a rabo).
TL;RD
Recomiendo la genética de la población: una guía concisa (Gillespie) para una introducción a la genética de la población/evolutiva (gracias AGS por resaltar esta gran falta mía en la primera versión de mi respuesta).
Recomiendo la guía de un biólogo para el modelado matemático en evolución y ecología (Otto y Day) si desea asegurar su conocimiento en matemáticas aprendiendo su aplicación a la biología evolutiva.
Libros de entrada general a la genética de poblaciones
Hay varios libros que ofrecen una introducción a la genética de poblaciones. Leí Principios de genética de poblaciones (Hartl & Clarke) . Lo aprecié, pero si fuera usted, creo que preferiría probar Elementos de genética de poblaciones (Charlesworth) o Genética de poblaciones (Hamilton) . También está Genética de Poblaciones (Hedrick) . Tiendo a pensar que este último libro presenta muchos datos empíricos de genética de poblaciones y no se enfoca tanto como los otros en conceptos teóricos (pero podría estar equivocado). Libro de Gillespie Genética de poblaciones: una guía concisaes un clasico Es breve, muy fácil de seguir y agradable de leer. El libro de Gillespie eventualmente podría estar un poco desactualizado, pero aun así lo recomendaría encarecidamente.
Énfasis en Modelado Analítico
La guía de un biólogo para el modelado matemático en evolución y ecología (Otto y Day) es un libro muy bueno y muy accesible. Hace un buen repaso a todas las materias que se suelen enseñar a los alumnos de primer año de Biología como álgebra lineal por ejemplo. Es muy accesible y mientras tanto va bastante lejos ya que termina hablando de la aplicación de la ecuación de difusión en genética de poblaciones (el trabajo de Kimura entre otros). Este libro presenta algunos modelos importantes en genética de poblaciones, pero como su objetivo es proporcionar las herramientas para el modelado matemático en ecología y evolución, puede subestimar algunos campos de la ecología y la biología evolutiva. Por ejemplo, el libro no habla sobre la estructura de la población ni sobre la teoría de juegos evolutivos y hay poco sobre la teoría Coalescente.
Otros libros que tratan temas específicos dentro de la genética de poblaciones
Coalescent Theory: an Introduction (John Wakeley) es un buen libro. No lo he leído completo tanto por cuestiones de tiempo como porque las matemáticas son un poco complicadas para mí. La teoría coalescente ofrece un conjunto muy importante de herramientas matemáticas en biología evolutiva.
También está la genética de poblaciones matemática (Ewens) . Actualmente lo estoy leyendo. Definitivamente no es un libro introductorio y realmente no cubre muchos de los campos más comunes en genética de poblaciones.
Si está particularmente interesado en la población estructurada por edad, Evolution in age-structured population (Charlesworth) es un libro muy bueno.
El modelado de la evolución (Roff) ofrece una discusión sobre cómo definir matemáticamente la aptitud a partir de los rasgos fenotípicos. Si bien es interesante, no le aconsejaría que lo compre. Además, todas las matemáticas son bastante básicas y su objetivo es explicar cómo realizar modelos matemáticos con R, lo que, en mi opinión, no es esencial para aprender, ya que otros lenguajes hacen un mejor trabajo en el manejo de las matemáticas (Mathematica, por ejemplo).
Evolutionary Conservation Biology (Ferrière, Couvet y Dieckmann) es un muy buen libro de conservación y genética de la conservación. Desarrolla algunos modelos matemáticos que son de especial interés para la conservación de poblaciones y comunidades.
Ecología, genética y evolución en metapoblaciones (Hanski y Gaggiotti) es un libro que también te puede interesar. Sin embargo, se centra mucho más en la ecología que los otros que he citado anteriormente. Nota: no lo he leído completo.
Si está interesado en la selección de parentesco y el nivel de selección, es posible que desee echar un vistazo a Major Transitions In Evolution (Maynard Smith y Szathmary), que es un clásico (aunque no lo he leído) o The Major Transitions in Evolution Revisited ( Calcott y Sterelny) que recogen la opinión de muchos autores sobre el tema. Evolutionary Dynamics: Exploring the Equations of Life (Nowak) también es de interés, especialmente. para aquellos interesados en la epidemiología. Finalmente, es posible que desee echar un vistazo a los libros extremadamente bien escritos y fáciles de leer de Dawkins, como The extended phenotype (Dawkins)por ejemplo. Los libros de Dawkins son muy populares y muy introductorios. Ofrece más una forma de pensar que la ciencia real detrás de la biología evolutiva.
A Biologist's guide to mathematical modelling in evolution and ecology (Otto and Day)
(vinculado en la publicación) brinda una introducción fácil a las ecuaciones de difusión pero no entra en los detalles de sus derivaciones. Espero que ayudeLa lista de @ Remi.b es excelente, pero también debería incluir la Genética de la población de Gillespie: una guía concisa .
No es relativamente corto, pero voy a repetir una recomendación que acabo de hacer en otro hilo. La genética de poblaciones y la teoría microevolutiva de Alan Templeton cubre muchos de los temas enumerados anteriormente y se basa en el autoaprendizaje de varias estadísticas de estructura de población, con ejemplos. Es un libro de texto introductorio para personas con cierta formación estadística (aunque también incluye un apéndice estadístico). También hay bastante discusión sobre la inferencia bayesiana y otros métodos de modelado.
Personalmente, me gusta el Primer on Population Biology de Wilson y Bossert. Para un libro que tiene casi 45 años, se sostiene bastante bien. Una de las mejores cosas de este libro es que proporcionan ejemplos y luego explican las soluciones paso a paso. De vez en cuando se vuelve un poco demasiado matemático para este biólogo, pero en general, lo encuentro legible e informativo.
Creo que este libro se ajusta muy de cerca a todos sus criterios.
hola_ahí_andy