Sé que la síntesis de proteínas se rige por muchos factores (principalmente estoy estudiando la vía mTOR), pero estoy buscando algún tipo de marcador que indique las tasas globales de síntesis de proteínas.
Sé que hay marcadores específicos de tejido (como la actina/miosina en el músculo) pero me gustaría algo más que sea ubicuo y proporcional a la producción global de proteínas (tal vez un músculo pueda producir más o menos miosina dependiendo de si hay algunos factores ).
Supongo que los factores de síntesis de proteínas (como mTOR, S6K1, etc.) se regulan rápidamente, por lo que no se pueden usar como marcadores.
Entonces, ¿cuál sería el mejor marcador molecular?
La respuesta no te satisfará. La verdad es que ningún marcador de proteína servirá.
Por un lado, parece estar mirando alguna proteína representativa individual, que podría medirse mediante inmunotransferencia. Pero la mayoría de las proteínas se encuentran en concentraciones escasas, tantas como se requieren para su trabajo, y suben y bajan según sus funciones específicas, en lugar de las tendencias metabólicas generales. Incluso si algún mecanismo de control general aumenta la síntesis de proteínas en todos los ámbitos, en una célula las proteínas son 20 % de actina, 20 % de tubulina, 0,0001 % de 4E-BP y 0,0001 % de p70-S6K (números inventados por el bien del ejemplo), cualquier El aumento del 1 % de proteína total que le gustaría medir sería 200 000 más fácil de detectar en tubulina que en p70-R6K. Para ser un marcador del control general de la síntesis de proteínas, la proteína marcadora que desea medir debe ser una proteína abundante, con poco o ningún control específico.
Por otro lado, esas son las características de un gen de mantenimiento de la casa. ¡Así que no podrá normalizar una mancha tan "representativa"! Normalizando el mantenimiento de la casa por el mantenimiento de la casa, no tendrá prácticamente ningún cambio.
Adopte los experimentos de etiquetado. Incluso allí, la correcta normalización es discutible. En todo caso, el hecho de que todos hagan eso, en lugar de mirar la proteína X, debería ser una indicación de cuánto le costará probar puntos sobre la tasa de síntesis de proteína usando cualquier otra cosa.
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