Simulación de acervo genético [cerrado]

En esta simulación, tomaste muestras del acervo genético sin reemplazar las cuentas en el vaso después de dibujar cada una. Por lo tanto, f(A) y f(a) en el acervo genético cambiaron ligeramente después de extraer cada cuenta. Por ejemplo, si comienza con 50 cuentas claras y 50 oscuras, la probabilidad de sacar una cuenta oscura la primera vez es 50/100 = 0,5. El vaso de precipitados contendría entonces 49 cuentas oscuras y 50 cuentas claras, por lo que la probabilidad de sacar una segunda cuenta oscura se convierte en 49/99 = 0,495. ¿Esto hace que su simulación sea un poco menos realista? En poblaciones naturales pequeñas, ¿cambia un apareamiento el acervo genético disponible para el próximo apareamiento, o no? ¿Qué factores biológicos deben considerarse para responder a esta pregunta?

Las preguntas de la tarea deben mostrar algún esfuerzo para responderlas usted mismo.
la no sustitución puede funcionar en el caso de una sociedad estrictamente monógama/monoándrica.

Respuestas (1)

No estoy seguro de estar respondiendo a tu pregunta, pero espero que esto te ayude.

Hay dos modelos principales de deriva genética en biología: el modelo de Moran y el modelo de Wright-Fisher.

El modelo de Wright-Fisher implica escoger norte perlas (donde norte es el tamaño de la población) con reemplazo para formar la nueva población. Por lo tanto, el cambio en la frecuencia alélica (debido a la deriva genética) sigue una distribución de Poisson.

2 norte ! pag k q 2 norte k k ! ( 2 norte k ) !

El modelo de Moran consta de lo siguiente: en cada paso de tiempo dibujas dos cuentas. Uno desaparece de la población y el otro se replica para mantener un tamaño de población estable.

Los dos modelos arrojan resultados similares. El modelo de Moran corre el doble de rápido que el modelo de Wright-Fisher.

No entiendo completamente tu modelo . Dices que en tu modelo eliges una cuenta a la vez. ¿Qué haces con esta perla? ¿Cómo construyes tu población en el siguiente paso de tiempo? ¿Permite cambios en el tamaño de la población? ¿Puede intentar desarrollar cómo definió su modelo? Si se trata de una simulación por computadora, puede pegar la parte importante de su código, eso podría ayudar.

Haldane y Kimura trabajaron mucho en estos modelos de deriva genética. Por ejemplo, proporcionan diferentes formas de calcular el tiempo medio de fijación de un alelo dado dado su coeficiente de selección. s a partir de una frecuencia inicial dada pag 0 . También se ha realizado algún trabajo sobre la deriva genética en la población donde el tamaño de la población cambia con el tiempo. Se han realizado algunos trabajos considerando funciones de densidad de probabilidad más o menos complejas para el número de descendientes por individuo. Este tipo de literatura es muy interesante, pero a veces pide un buen conocimiento de las matemáticas (especialmente para los artículos de Kimura).

Una vez hice esta pregunta sobre los diferentes modelos de deriva genética y sus suposiciones , pero aún no obtuve una respuesta.