¿Se transcribe la región promotora de un gen?

¿Formaría la porción inicial de ARNm poco después de la unión mediante la lectura de la región promotora?

La ARN polimerasa se une al promotor, sin embargo, dado que es tan grande, su extremo frontal cuelga del extremo del promotor. Cuando comienza la transcripción, el promotor no está incluido, ya que el proceso de transcripción ocurre al frente de la polimerasa.

Además, ¿la ARN polimerasa lee los pares de bases de ADN uno por uno y agrega los pares de bases de ARN a la cadena uno por uno?

La ARN polimerasa agrega nucleósido trifosfato (NTP) uno por uno. Como muestra la imagen a continuación, solo hay espacio para un NTP en el sitio activo y, una vez que se coloca el NTP correcto, se agrega a la cadena de ARN.

¿Cómo termina el proceso simplemente leyendo la región del terminador?

La cuestión de la terminación depende de la célula. Los procariotas terminan en un proceso independiente o dependiente de Rho. De forma independiente, se produce una horquilla en el ARN que rompe la transcripción, de forma dependiente, se une un factor Rho que provoca la terminación. Los eucariotas son menos conocidos, pero generalmente se cree que después del sitio poli-A también hay factores que se unen e inducen la terminación.

Entonces, ¿deberían considerarse las regiones promotora y terminadora de un gen partes del gen o entidades separadas?

Esta pregunta es un poco más sobre definiciones que biología. El diccionario Oxford Engligh define un gen como "La unidad básica de herencia en los organismos vivos". Dado que las regiones promotora, no codificante y no traductora siguen siendo fundamentales para producir la proteína, diría que siguen siendo parte del gen y de la unidad hereditaria más grande.