¿Por qué la tabla de codones de ADN es "igual" a la tabla de codones de ARN?

Antes que nada, preste atención a las comillas dobles en "igual" en el título. Sé que no son iguales, pero lo entenderá en un momento.

Si miro la tabla de codones de ADN aquí o en wikipedia , y la tabla de codones de ARN aquí o en wikipedia , su única diferencia es que el primero tiene timina (T) mientras que el segundo tiene uridina (U). Pero no entiendo cómo todos los demás nucleótidos son iguales. Tenga en cuenta que la transcripción lee el ADN desde 3'->5' y la traducción lee el ARNm desde 5'->3'.

Mire este ejemplo, centrándose en el 3'-TAC-5' de la hebra antisentido.

ingrese la descripción de la imagen aquí

El 3'-TAC-5' codifica la tirosina de acuerdo con la tabla de codones de ADN. Sin embargo, transcribe y traduce 3'-TAC-5' -> 5'-AUG-3' -> Metionina.

Ahora concéntrese en el codón correspondiente en la hebra con sentido, 5'-ATG-3', que codifica Valina de acuerdo con la tabla de ADN (se lee de 3' a 5'). Este codón transcribe y traduce 3'-GTA-5' -> 5'-CAU-3' -> Histidina, no Valina ni Metionina.

Entonces mis preguntas son:

  1. ¿Por qué las tablas de codones de ADN muestran la correspondencia entre codones y aminoácidos en las cadenas con sentido (5'-ATG-3'), si la única manera de pasar de ATG a Met como en la figura es considerar la cadena antisentido?
  2. Puedo ver que el codón AUG se traduce a Metionina, y se traduce leyendo el codón 3'-TAC-5' en la hebra antisentido, cuyo codón correspondiente en la hebra sentido es 5'-ATG-3'. Pero este último se lee desde 3'->5', por lo que lee 3'-GTA-5' -> 5'-CAU-3' -> His.

Supongo que me estoy equivocando en muchas cosas en esto... Tal vez en la forma en que estoy leyendo las tablas: siempre tomo en cuenta que la transcripción se lee 3'->5' y este es el orden que tomo para Leer tablas de ADN.

Gracias y perdón si me confundí.

La traducción se realiza en el ARNm, no en la hebra antisentido, y se realiza desde 5' -> 3'. El primer codón es AUG. Este es un código de inicio y códigos para metionina. Consulte también esta explicación ilustrada .
Sí, entiendo por qué AUG se traduce como metionina. Mi pregunta es por qué la gente se refiere a la codificación del codón ATG para la metionina si ATG -> UAC -> His. Pero creo que el mensaje principal fue que estaba leyendo las tablas como lo haría la polimerasa, y esto no es lo correcto :)
eh, ahora entiendo eso :) Estaba leyendo 5'-ATG-3' -> 3'-UAC-5' -> Su porque estaba buscando el orden de nucleótidos según el orden de transcripción/traducción

Respuestas (2)

El código genético y los codones siempre se usan con referencia al ARN. Cuando se habla de ADN, la hebra sentido de un gen se considera su secuencia. Aunque la hebra antisentido es la plantilla para la síntesis de ARNm, no representa el gen.

La tabla de codones de ADN simplemente ha reemplazado a U por T. Aparte de un artículo de wikipedia, no encuentro que el término se use popularmente (no coloquialmente) en otros lugares.

¿Quizás le gustaría agregar algo acerca de que la lectura de esas tablas no tiene que ver con la dirección de lectura de la polimerasa? Este parece haber sido mi problema.
@Sosi La lectura de esas tablas está directamente relacionada con la dirección de la polimerasa. La polimerasa lee 5' a 3', la traducción ocurre también en esa dirección, y esa es la dirección en la que se leen las tablas.
@Sosi, como mencioné , aunque la hebra antisentido es la plantilla para la síntesis de ARNm, no representa el gen . La dirección del movimiento de la ARN polimerasa no es un factor aquí.
@JasonC: Solo como aclaración: la ARN polimerasa lee 3'→ 5' pero produce 5'→ 3'.
@WYSIWYG esa es exactamente mi fuente de confusión: si está leyendo un hilo 5'-ATG-3' de 3'-> 5', estaría leyendo GTA. Pero a pesar de "caminar" la hebra de ADN en el 3'->5', todavía lo lee ATG, ¿eso es todo?
@Sosi.. No RNAP lee una cadena 3'→ 5' (con 3'-…-TAC-…-5') y produce un 5'…-AUG-…-3'ARNm. Y tenga en cuenta que la síntesis de ARN no comienza en ATG(es la síntesis de proteínas).

Puedo entender tu confusión, pero todo tiene sentido. La idea básica es que lo que llamamos el hilo "antisentido" es en realidad el que se transcribe. Sin embargo, dado que en efecto es una imagen especular, es mucho más sencillo pensar en términos de la hebra sensorial.

Para tomar un ejemplo muy simple:

5' ATG 3' <-- sense strand
3' TAC 5' <-- antisense strand

La hebra antisentido se leerá en una dirección de 3' a 5':

3' TAC 5' <-- antisense strand
5' AUG 3' <-- mRNA

Dado que el ARNm es una imagen especular, tiene la secuencia de la hebra sentido. Es este ARNm el que luego se traduce y se lee en una dirección de 5' a 3'. Entonces, AUG se traduce como Met. Para ilustrar, eche un vistazo a esta imagen de Wikipedia (haga clic en ella para ver una versión más grande),

                                                             animación de traducción de proteínas

En la imagen de arriba, puede ver la cadena polipeptídica (proteína) en crecimiento serpenteando a través del ribosoma. Las cosas azules voladoras son moléculas de ARNt y la cadena negra en la parte inferior es el ARNm que se está traduciendo. Realmente no puedes verlo muy bien en esta imagen, pero si miras el original puedes ver claramente que se está moviendo de derecha a izquierda. El lado derecho es el extremo 5' y el izquierdo es el 3'. O, en una versión más estática (adaptado de aquí ):

       traduccion de proteinas

Entonces, la cadena antisentido se lee, se transcribe a ARN (que tiene la secuencia de la cadena sentido pero con T convertida en U) y es este ARNm el que se lee (en una dirección de 5' a 3') para producir la proteína.

¡Gracias! Pero esto plantea otra pregunta en mi mente. Parece una especie de "desperdicio" tener el hilo de sentido allí si solo se transcribe el antisentido. ¿La hebra sentido no hace nada más que estabilizar el ADN y no se lograría lo mismo teniendo ARNm solo en lugar de ADN?
@Sosi no, las cadenas dobles son esenciales para muchas cosas, incluidas i) la replicación del ADN ii) la reparación de errores (la secuencia "correcta" se puede inferir de la cadena opuesta iii) lo más importante, los genes se pueden encontrar en ambas cadenas. El sentido/antisentido es solo con respecto a un gen dado. La hebra con sentido de geneX puede ser antisentido de geneY.
¡Gracias! Ya veo, estaba malinterpretando y pensando que el hilo de los sentidos siempre fue el hilo de los sentidos :)