¿Se agrega la cola poli(A) mientras la transcripción aún está en curso?

Es un poco más complicado de lo que indican los comentarios anteriores.

Glover-Cutter, K et al. (2007) La ARN polimerasa II se detiene y se asocia con factores de procesamiento de pre-ARNm en ambos extremos de los genes. Naturaleza Estructural y Biología Molecular 15: 71-78

Los autores presentan pruebas de que la ARN polII se detiene 0,5 - 1,5 kb aguas abajo del sitio poli(A) donde se reclutan los factores de procesamiento (factor de estimulación de escisión, o CstF, y factor de especificidad de poliadenilación de escisión, CPSF). Por lo tanto, la polimerasa todavía está comprometida con la plantilla y el premRNA cuando se inicia el procesamiento, aunque es posible que no esté elongando activamente la transcripción.

"La localización del complejo de procesamiento del extremo polII-3' activo aguas abajo de la secuencia de consenso poli(A) concuerda bien con la escisión de las transcripciones de Chironomus BR1 después de que se hayan transcrito 600 bases de la secuencia aguas abajo. Este modelo también está respaldado por el hecho de que la escisión eficiente del sitio poli(A) requiere una atadura de ARN intacta que une el sitio poli(A) con la polimerasa aguas abajo". ( las referencias se citan en el original ).

Es una cuestión semántica si llamas a esto procesamiento cotrancripcional.

[Por cierto, este es otro ejemplo más que contradice la idea comúnmente establecida de que la evolución actúa para optimizar todo para conservar ATP; aquí tenemos el proceso de transcripción que descarta la energía de aproximadamente 1000 enlaces fosfodiéster por transcripción ].

ACTUALIZACIÓN @WYSIWYG La polimerasa pasa por el sitio donde finalmente se agregará el poli(A) y crea otras 1000 bases de ARN antes de hacer una pausa para reclutar los factores que se necesitan para la división posterior en el sitio pol(A) que ahora se encuentra " Detrás de eso". Después de eso, se agrega la cola polivinílica (A) en el extremo 3 'recién creado. Entonces, el inicio de la adición de poli(A) (en el sentido de que la escisión es un primer paso obligatorio en el proceso) se logra mientras la polimerasa aún está activa. Estoy de acuerdo en que la adición real del poli(A) no puede considerarse de ninguna manera como cotrancripcional.

Estaba tratando de señalar que no se trata simplemente de que la polimerasa encuentre el sitio de escisión y se caiga para permitir que tenga lugar un segundo proceso no vinculado.

Como han dicho otros, el empalme ocurre cotranscripcionalmente, pero no puede transcribir activamente el ARN mientras se transcribe. Sin embargo, generalmente se acepta que una transcripción se puede poliadenilar mientras la ARN polimerasa aún se está transcribiendo; esto se denomina modelo de torpedo. La distinción es que la transcripción se ha escindido entre la polimerasa y la poliA, pero aún formaban parte del mismo evento transcripcional. Vea la figura aquí... http://www.nature.com/nsmb/journal/v11/n12/fig_tab/nsmb1204-1156_F1.html