Relación de absorbancia muy alta de 260/230 de una muestra de ARN

Después de mi extracción de ARN más reciente, las muestras de ARN tenían índices de absorbancia muy altos de 260/230 (entre 5 y 25).

Nunca he obtenido números como este y sé que se supone que la proporción es ~2 en general.

¿Cuál podría ser la razón de una absorbancia 260/230 tan alta?

¿ Scientistsolutions.com/t11627-high+260_230+ratio+for+dna.html sugiere que las altas proporciones son causadas por altas concentraciones de sal en su muestra?
Gracias por el enlace, pero según mi experiencia, la contaminación por sal causaría una proporción baja de 260/230, ya que las sales se absorben a 230 nm.

Respuestas (2)

Gergana tiene razón sobre los efectos del isotiocianato de guanidina, pero no sobre los detalles. El isotiocianato de guanidina se absorbe fuertemente a 260 y NO a 230 (la clorhidrato de guanidina es la que se absorbe fuertemente a 230). Como tal, si su ARN está altamente contaminado con isotiocianato de guanidina, que se usa en al menos un tampón en casi todos los kits de preparación de ARN, su 260/230 será mucho más grande que 2 (también la "concentración" será artificialmente alta Entonces, si está obteniendo un 260/230 de 25 y tiene una "concentración" de "1000 ng/µL", es posible que en realidad tenga menos de 200 ng/µL de ARN y una tonelada de isotiocianato de guanidina desechando todo).

La relación 260/230 le da una idea de los contaminantes en su muestra. El isotiocianato de guanidina, que generalmente se usa para el aislamiento de ARN, se absorbe a 230 nm, por lo que eso podría ser lo que ve. Pero otra explicación podría ser que su muestra está muy diluida (¿cuánto ARN obtuvo?), por lo que su A260 también es muy bajo. Entonces sería difícil medir con precisión A230, lo que resultará en relaciones 260/230 sobreestimadas.

La concentración de ARN no fue más baja de lo habitual (1000 ng/µL), pero en el futuro tendré en cuenta esta posibilidad.