¿Qué significa el nombre del gen "lexA"?

Es un gen importante expresado en E. coli que reprime la respuesta SOS y también la expresión de genes de fase lítica lambda. La luz ultravioleta y el daño al ADN son responsables de su descomposición y, por lo tanto, de la expresión de genes de reparación y, si están presentes, genes del fago lambda. Sin embargo, no pude encontrar una referencia para su nombre original.

What does gene name X stand for?Creo que podría estar esperando un poco demasiado de las convenciones de nomenclatura estándar...
¿Qué convenciones de nomenclatura?
Creo que hay algunas conjeturas aquí. He buscado bastante extensamente y la información no está disponible. Nada concluyente. Lambda es un depresor diferente, digno de mención. Me pondría en contacto con la persona que lo descubrió: Miroslav Radman, Prof. Fundador tel:+385(0)21555601 fax:+385(0)21555605 e-mail:miroslav.radman@medils.hr
@Masih Enlacé un artículo en mi respuesta editada que creo que aclara parte de la confusión en "Lambda Excision".

Respuestas (4)

Yo elegiría Lambda Excision A. Términos como lex o rec a menudo representan lo que se denominaría mnemotécnico, donde, por ejemplo, rec puede significar recombinación o umu para mutador UV. Las convenciones de nomenclatura pueden ser difíciles.

Editar: un estudio de 1981 realizado por Roger Brent y Mark Ptashne señala algunos datos de estudios iniciales que mostraron que el represor lexA reguló a la baja una serie de genes, incluido himA, que señalan que es necesario para la integración del fago lambda.

http://www.pnas.org/content/78/7/4204.full.pdf

Según este sitio web , es un mnemotécnico para "escisión lambda". También encontré este uso en la literatura científica (por ejemplo, Harami et al., 2013). Sin embargo, ninguna de estas fuentes hace referencia a nada y no puedo encontrar ningún documento definitorio. Casi todos los periódicos simplemente se refieren a él como lexA.

Por lo que puedo encontrar (es difícil desenterrar estos documentos antiguos), así es como se describió originalmente el locus (no necesariamente el gen) (Howard-Flanders y Boyce, 1966):

Hay un... locus, lex (locus para la sensibilidad a los rayos X), en E. coli K-12... [Una] mutación en este locus aumenta el grado de descomposición del ADN inducida por UV. Este efecto es similar, pero menos extremo, al del locus rec ...

Es posible que, dado que este locus se caracterizó mejor, el nombre lex se mantuvo por coherencia con la literatura anterior, pero se redefinió para reflejar una mejor comprensión de su función (aunque no creo que la "escisión lambda" lo haga muy bien).


Referencias

Harami GM, Gyimesi M, Kovacs M. 2013. De las llaves a las excavadoras: roles en expansión para los dominios de hélice alada en las proteínas de unión a ácidos nucleicos. Tendencias Biochem Sci 38(7):364-371

Howard-Flanders P, Boyce RP. 1966. Reparación de ADN y recombinación genética: estudios sobre mutantes de Escherichia coli defectuosos en estos procesos. Radiat Res Supp 6: 156-184

Mutante sensible a los rayos X de Lee Theriot https://thebradentontimes.com/lee-frances-theriot-p24426-154.htm Yo era un postdoctorado con Joseph Greenberg trabajando en el mismo campo en ese momento

Esto está bien documentado en Advances in Microbial Physiology , volumen 16, Moseley y Williams, páginas 116-117 (buscable a través de Google Books).

Mattern et al. (1966) designaron mutaciones que hicieron que E. coli Bs-1 fuera sensible a la radiación de rayos X como mutaciones exr (sensibilidad a los rayos X). Ese mismo año, Howard-Flanders y Boyce (1966) designaron de forma independiente mutaciones equivalentes en E. coli K-12 como lex (locus para la sensibilidad a los rayos X). En ambas cepas, estas mutaciones estaban cerca del locus malB ( b4039 ; lexA es b4043 ). Un año más tarde, Greenberg estaba utilizando una designación más amplia con la misma raíz causal (Loci para la sensibilidad a la radiación) para designar estas mismas mutaciones.

LexA también se conoce como umuA ( inducción UV de mutaciones ) y tsl ( mutaciones termosensibles ).