¿Qué secuencias hay entre genes adyacentes?

El genoma humano tiene muchas regiones no codificantes, que incluyen elementos reguladores, ADN repetitivo e intrones. Supongamos que hay dos genes adyacentes en un cromosoma y sus posiciones en el cromosoma son, digamos,

Para el primer gen: 11.785.723 a 11.803.245 pb.

Para el segundo gen: 11.806.096 a 11.806.143 pb. Estos valores incluyen también sus elementos reguladores, promotor e intrones.

Entonces, ¿qué secuencia está presente entre las bases 11.803.245 y 11.806.096? ¿Son secuencias de satélite? ¿Esta región no reguladora y no codificante es heterocromatina de 11 803 245 a 11 806 096 pb?

Es la misma pregunta, pero con una consulta adicional: ¿son esas regiones heterocromatina? ¿Todas las regiones de ADN repetitivo, como los microsatélites, son heterocromatina? ¿O la heterocromatina es solo las secuencias repetitivas de telómeros y centómeros?

Respuestas (1)

No. Las regiones intergénicas no son necesariamente heterocromatina. Las conformaciones de cromatina suelen tener un rango muy largo y no suelen estar confinadas a un solo gen. La propagación del estado de la cromatina puede evitarse mediante elementos aislantes/fronterizos , que de nuevo no forman parte de la región transcrita. Las regiones intergénicas también pueden albergar elementos reguladores distales como potenciadores y silenciadores; también pueden tener microsatélites, transposones, etc. Para saber qué hay en una región específica, puede mirar las diferentes pistas en el navegador del genoma de UCSC .

En resumen, puede haber ADN funcional y/o no funcional entre las regiones transcritas.

Las regiones repetidas no necesitan ser heterocromatizadas y, por el contrario, no todas las regiones heterocromáticas consisten en repeticiones.

¿Se puede decir al menos que todas las secuencias repetidas no son funcionales?
@Charles No, realmente no puedes decir eso. Las repeticiones teloméricas son importantes. También lo son las repeticiones centroméricas. Hay repeticiones no en tándem como LINE; han sido implicados en la heterogeneidad somática en el cerebro.
¿Todas las partes no funcionales del genoma, como las secuencias satélite no funcionales, están heterocromatizadas?