Sé que los microbios no son capaces de reproducirse sexualmente, por lo que clasificarlos en especies de acuerdo con "grupos que pueden cruzarse y generar descendencia fértil" no debería aplicarse.
Su pregunta es relativa al concepto de especie que está utilizando. El concepto de especie biológica de Mayr (BSC) se basa en la capacidad de cruzarse; una definición basada en procesos. La mayoría de los biólogos lo usan, pero la mayoría de los taxónomos, que son las personas que realmente describen las especies, usan alguna variación del concepto de especie filogenética. El concepto de especie filogenética no se basa en procesos, sino en diferencias fijas. Las diferencias fijas son evidencia de la falta de mestizaje, pero el concepto no se basa explícitamente en la reproducción. Se han utilizado diferencias morfológicas fijas para clasificar los microbios, con mayor frecuencia en cultivo. Pero actualmente, los microbios se clasifican con mayor frecuencia con una combinación de caracteres morfológicos y genéticos. La pequeña subunidad de ARNr se secuencia y se somete a un algoritmo para estimar especies en función de las distancias genéticas. En breve, su pregunta depende mucho del concepto de especie que esté utilizando y de si aceptaría una definición de ADN basada en la distancia. Pero las especies no necesitan ser definidas reproductivamente.
Esta pregunta en realidad no tiene una respuesta fácil. Como se indicó en una respuesta anterior, muchos científicos utilizan el gen 16S rRNA. Dado que esta es una región genética bastante conservada, las mutaciones en esta región pueden diferenciar especies filogenéticamente, pero no es un método infalible. Por ejemplo, varias especies de Shigella pueden producir secuencias 16S casi idénticas a las de Escherichia coli.y surgen debates sobre si, de hecho, deberían clasificarse como la misma especie. Algunos científicos incluso niegan que existan especies microbianas o, si las hay, que poder agrupar microbios en unidades taxonómicas no valga la pena ni sea informativo (aunque estos científicos todavía son una minoría). Si desea saber más sobre ese punto de vista, puede consultar el trabajo de WF Doolittle. Esta es una lectura divertida:
Doolittle, W. y Zhaxybayeva, O. (2009). Sobre el origen de las especies procarióticas. Investigación del genoma, 19(5), 744-756. http://dx.doi.org/10.1101/gr.086645.108
Ro Siv
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