Proyecto simple de biología computacional para la clase de Biología AP. ¿Ideas? [cerrado]

Nuestro maestro nos asignó un proyecto para hacer con un mensaje extremadamente abierto y debe completarse dentro de un mes. Planeaba hacer algo relacionado con la computación y la evolución en términos de biología, aunque no estoy muy seguro de por dónde empezar. Digo simple porque no soy un programador profesional, más bien estoy extremadamente interesado en el campo y espero usar esto como una oportunidad para ampliar mis habilidades. Cualquier idea sobre un proyecto o por dónde empezar sería muy apreciada.

Bienvenido al sitio. Desafortunadamente, Biology.SE no es un foro y su pregunta se basa bastante en opiniones. Desde el centro de ayuda , If your motivation for asking the question is “I would like to participate in a discussion about ______”, then you should not be asking here.sin embargo, las búsquedas simples de Google arrojarán muchos resultados para ideas de proyectos, así como sitios donde este tipo de discusión sería sobre el tema, como Reddit o Quora. ¡Buena suerte!
Esta podría ser una discusión apreciada en Reddit bioinformática . Pregunte por dónde empezar, cuáles son las herramientas rápidas y fáciles de usar, y cómo sacar algo significativo de los resultados.

Respuestas (2)

Puede usar los recursos de BLAST o NCBI para hacer un análisis de algo como la duplicación de un gen en el virus del VIH, por ejemplo. Si está buscando un lugar para comenzar, le recomendaría simplemente aprender los recursos de la base de datos NCBI.

Además de lo que sugirió Ham Radio, verificar Galaxy podría no ser una mala idea para realizar cualquier tipo de cálculo/análisis que, de lo contrario, tendría que realizarse en la línea de comandos. En particular, consulte las herramientas para la alineación de secuencias (BWA y Bowtie), ensamblaje de genomas (Velvet, Spades, IDBA-UD) y análisis de variantes (Freebayes, Mpileup, GATK). ¡Buena suerte!